More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0229 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  100 
 
 		 291 aa  591  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  68.64 
 
 		 338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  58.16 
 
 		 291 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  52.04 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  55.84 
 
 		 269 aa  261  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  59.73 
 
 		 289 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  48.12 
 
 		 352 aa  208  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  50.67 
 
 		 434 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  44.24 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  47.96 
 
 		 313 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  44.72 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  47.39 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  43.14 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  42.61 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  45.95 
 
 		 469 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  45.75 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  45.81 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  50 
 
 		 219 aa  175  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  40.77 
 
 		 213 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  41.2 
 
 		 213 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  45.16 
 
 		 304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  44.93 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  40 
 
 		 290 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  41.98 
 
 		 225 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  42.45 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  46.26 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  40.36 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  40.96 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  45.88 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  42.11 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  45.02 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  46.63 
 
 		 225 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  39.51 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  41.15 
 
 		 230 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  41.92 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  42.24 
 
 		 247 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  40.54 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  45.11 
 
 		 254 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  42.18 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  39.06 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  37.81 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  35.92 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  33.92 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  33.69 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  37.09 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  36.13 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  36.13 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  36.13 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  36.41 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  36.7 
 
 		 184 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  35.29 
 
 		 216 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  36.79 
 
 		 199 aa  125  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  38.03 
 
 		 174 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  37.38 
 
 		 173 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  37.93 
 
 		 216 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  37.26 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  38.12 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  32.65 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  34.38 
 
 		 185 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  33.77 
 
 		 214 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  35.22 
 
 		 216 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  36.7 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  32.49 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  35.51 
 
 		 181 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  35.59 
 
 		 221 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  35.44 
 
 		 200 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  35.44 
 
 		 200 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  35.08 
 
 		 192 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  34.22 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  36.68 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  33.49 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  34.86 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  32.71 
 
 		 187 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  35.92 
 
 		 193 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  32.2 
 
 		 209 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  36.04 
 
 		 225 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  31.22 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  33.48 
 
 		 235 aa  102  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  34.42 
 
 		 197 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  33.62 
 
 		 219 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  30.77 
 
 		 190 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  35.87 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  33.18 
 
 		 190 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  34.33 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.93 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  31.6 
 
 		 186 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  34.65 
 
 		 173 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  32.3 
 
 		 240 aa  99.4  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34 
 
 		 200 aa  99  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  35.75 
 
 		 198 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  34.8 
 
 		 215 aa  99  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  34.78 
 
 		 171 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  33.78 
 
 		 220 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.02 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  31.73 
 
 		 250 aa  97.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  34.47 
 
 		 208 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  31.78 
 
 		 288 aa  95.9  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  34.18 
 
 		 185 aa  95.5  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  32.21 
 
 		 173 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  33.01 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>