More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3589 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  100 
 
 		 352 aa  699    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  68.44 
 
 		 434 aa  359  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  48.12 
 
 		 291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  47.76 
 
 		 338 aa  222  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  53.74 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  49.39 
 
 		 291 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  44.33 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  47.58 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  48.66 
 
 		 290 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  48.24 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  49.78 
 
 		 269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  42.86 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  43.24 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  44.98 
 
 		 213 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  44.54 
 
 		 213 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  46.05 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  39.84 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  41.13 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  41.46 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  43.38 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  42.23 
 
 		 261 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  39.5 
 
 		 209 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  44.16 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  42.26 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  41.35 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  39.52 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  33.33 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  36.8 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  41.84 
 
 		 225 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  41.59 
 
 		 220 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  41 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  37.5 
 
 		 294 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  41.77 
 
 		 298 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  39.46 
 
 		 290 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  33.57 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  36.48 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  36.48 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  36.48 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  37.66 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  33.58 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  38.67 
 
 		 247 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  37.41 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  40.11 
 
 		 225 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  36.97 
 
 		 192 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  37.6 
 
 		 254 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  40 
 
 		 197 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  39.68 
 
 		 219 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  37 
 
 		 181 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  39.68 
 
 		 193 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  42.36 
 
 		 251 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  37.16 
 
 		 190 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  37.37 
 
 		 200 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  37.37 
 
 		 200 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  38.58 
 
 		 214 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  39.66 
 
 		 234 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  32.68 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  33.17 
 
 		 185 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  39.41 
 
 		 215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  35.61 
 
 		 173 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  38.17 
 
 		 220 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  34.95 
 
 		 189 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  33.68 
 
 		 197 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  34.68 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  33.17 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  37.31 
 
 		 188 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  36.98 
 
 		 174 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  36.6 
 
 		 209 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  33.02 
 
 		 187 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  35.58 
 
 		 190 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  36.41 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  35 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  38.69 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  38.89 
 
 		 208 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  36.87 
 
 		 171 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  40.46 
 
 		 203 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  30.85 
 
 		 186 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  35.82 
 
 		 186 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  38.07 
 
 		 247 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  37.5 
 
 		 221 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  35.98 
 
 		 196 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  35.07 
 
 		 184 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  35.78 
 
 		 192 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  31.93 
 
 		 220 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  34.74 
 
 		 189 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  32.75 
 
 		 221 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  34.67 
 
 		 199 aa  99.8  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  31.25 
 
 		 176 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  35.89 
 
 		 238 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  27.78 
 
 		 173 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  33.33 
 
 		 189 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  32.63 
 
 		 198 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  31.91 
 
 		 271 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  29.95 
 
 		 193 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  32.42 
 
 		 215 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  30.41 
 
 		 233 aa  96.3  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  32.83 
 
 		 173 aa  95.9  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  34.25 
 
 		 170 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  32.6 
 
 		 216 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  35.62 
 
 		 235 aa  94  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  32.88 
 
 		 216 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>