More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1311 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  93.43 
 
 
213 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  57.48 
 
 
261 aa  225  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  47.39 
 
 
360 aa  208  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  56.1 
 
 
230 aa  207  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  50 
 
 
291 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  48.88 
 
 
289 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  48.06 
 
 
209 aa  187  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  44.4 
 
 
338 aa  181  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  46.02 
 
 
269 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  41.2 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  52.08 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  43.35 
 
 
289 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  47.16 
 
 
434 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  41.95 
 
 
290 aa  168  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  43.86 
 
 
313 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  44.98 
 
 
352 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  39.22 
 
 
268 aa  157  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  42.42 
 
 
311 aa  155  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  40.83 
 
 
304 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  39.91 
 
 
341 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  40.35 
 
 
284 aa  149  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  39.04 
 
 
279 aa  148  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  40 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  37.07 
 
 
272 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  41.83 
 
 
290 aa  141  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  38.89 
 
 
225 aa  141  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  37.39 
 
 
304 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  40.09 
 
 
298 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  38.96 
 
 
225 aa  138  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  37.73 
 
 
469 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  38.5 
 
 
267 aa  135  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  40.89 
 
 
251 aa  134  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  37.44 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  37.32 
 
 
266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  41.45 
 
 
254 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  36.05 
 
 
267 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  37.22 
 
 
299 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  37.61 
 
 
247 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  34.43 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  35.15 
 
 
284 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  39.89 
 
 
219 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  40.72 
 
 
243 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  42.37 
 
 
199 aa  123  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  38.74 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  34.93 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  33.74 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  33.74 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  33.74 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  37.82 
 
 
181 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  36.32 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  36.32 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  35.83 
 
 
220 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  36.76 
 
 
190 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  40.86 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  35.29 
 
 
216 aa  112  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  35.07 
 
 
220 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  37.88 
 
 
190 aa  111  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  33.99 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  38.17 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  34.65 
 
 
309 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  35.33 
 
 
192 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  35.33 
 
 
193 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  38.02 
 
 
173 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  37.36 
 
 
187 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  35.75 
 
 
342 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  35.87 
 
 
197 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  34.54 
 
 
185 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  34.9 
 
 
209 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  36.36 
 
 
174 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  39 
 
 
221 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  34.81 
 
 
176 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  36.96 
 
 
262 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  37.76 
 
 
171 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  35.56 
 
 
188 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  36.53 
 
 
191 aa  102  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  35.96 
 
 
214 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  36.07 
 
 
183 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  32.83 
 
 
183 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  37.5 
 
 
192 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  32.83 
 
 
183 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  32.83 
 
 
183 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  32.83 
 
 
183 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  32.83 
 
 
183 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  32.83 
 
 
183 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  37.31 
 
 
184 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  32.83 
 
 
183 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  34.13 
 
 
216 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  34.27 
 
 
216 aa  101  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  32.32 
 
 
183 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  32.32 
 
 
183 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  36.27 
 
 
225 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  32.26 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  32.55 
 
 
219 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  35.48 
 
 
247 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  36.76 
 
 
225 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  32.29 
 
 
221 aa  99  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  29.79 
 
 
231 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  32.32 
 
 
183 aa  98.6  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  32.32 
 
 
183 aa  98.6  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>