More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11110 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  100 
 
 		 268 aa  546  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  48.95 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  48.06 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  51.54 
 
 		 247 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  44.57 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  44.24 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  47.93 
 
 		 254 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  40.47 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  44.6 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  43.5 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  41.46 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  47.5 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  51.05 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  43.64 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  41.49 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  47.03 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  46.67 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  47.42 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  46.38 
 
 		 469 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  42.18 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  44.95 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  43.04 
 
 		 434 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  39.66 
 
 		 213 aa  158  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  46.2 
 
 		 219 aa  158  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  39.22 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  44.91 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  43.13 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  41.51 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  41.46 
 
 		 352 aa  152  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  41.63 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  41.48 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  42.73 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  41.95 
 
 		 220 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  36.92 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  41.12 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  35.83 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  40.37 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  37.98 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  40 
 
 		 288 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  39.34 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  36.69 
 
 		 261 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  35.93 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  33.33 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  40 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  34.48 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  39.19 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  35.9 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  37.44 
 
 		 190 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  36.79 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  36.46 
 
 		 192 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  32.53 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  37.56 
 
 		 171 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  31 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  34.84 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  36.21 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  36.19 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  35.78 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  36.23 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  31.74 
 
 		 230 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  36.49 
 
 		 198 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  34.57 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  34.57 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  33.67 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  34.93 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  34.57 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  34.43 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  36.19 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  37.31 
 
 		 197 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  34.25 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  31.65 
 
 		 197 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  37.85 
 
 		 221 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  31.65 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  36.19 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  38.57 
 
 		 225 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  31.53 
 
 		 186 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  33.33 
 
 		 191 aa  103  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  33 
 
 		 181 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  34.18 
 
 		 200 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  34.18 
 
 		 200 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  36.02 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  31.02 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  33.33 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  34.48 
 
 		 209 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  33.19 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  34.1 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  35.12 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  36.62 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  35.07 
 
 		 184 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  34.78 
 
 		 188 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  36.23 
 
 		 216 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  34.63 
 
 		 173 aa  99.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  34.05 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  34.55 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  34.04 
 
 		 188 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  34.04 
 
 		 188 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  32.14 
 
 		 185 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  35.47 
 
 		 208 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  31.79 
 
 		 193 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  34.25 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  33.33 
 
 		 174 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>