More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2477 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  100 
 
 		 304 aa  617  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  64.63 
 
 		 290 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  46.55 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  47.89 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  50.45 
 
 		 284 aa  210  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  42.57 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  49.79 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  49.6 
 
 		 247 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  40.47 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  53.48 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  42.17 
 
 		 266 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  43.27 
 
 		 291 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  44.74 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  44.24 
 
 		 469 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  45.19 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  39.51 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  40.09 
 
 		 199 aa  159  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  38.99 
 
 		 360 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  42.92 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  40.44 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  37.07 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  39.41 
 
 		 209 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  36.98 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  37.39 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  44.1 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  42.92 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  37.39 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  37.99 
 
 		 216 aa  142  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  42.86 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  40.34 
 
 		 290 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  38.36 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  37.39 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  39.46 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  39.24 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  39.05 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  38.25 
 
 		 304 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  34.64 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  35.29 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  39.22 
 
 		 225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  37.3 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  37.9 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  38.11 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  38.11 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  38.11 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  37.66 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  35.27 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  31.99 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  37.66 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  31.83 
 
 		 341 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  35.41 
 
 		 230 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  36.24 
 
 		 272 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  32.92 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  33.33 
 
 		 214 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  36.41 
 
 		 200 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  36.41 
 
 		 200 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  36.22 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  37.56 
 
 		 190 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  32.7 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  36.55 
 
 		 199 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  33.95 
 
 		 192 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  35.75 
 
 		 186 aa  99  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  31.19 
 
 		 200 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  34.98 
 
 		 197 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  35.79 
 
 		 189 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  35.2 
 
 		 193 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  38.57 
 
 		 247 aa  96.7  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  34.34 
 
 		 198 aa  96.3  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  33.33 
 
 		 220 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  32.35 
 
 		 173 aa  95.5  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  32.51 
 
 		 173 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  34.25 
 
 		 192 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  32.88 
 
 		 199 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  35.53 
 
 		 190 aa  94  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  33.85 
 
 		 197 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  34.39 
 
 		 185 aa  93.6  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  33.8 
 
 		 185 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  31.15 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  33.5 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  32.5 
 
 		 220 aa  91.3  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  31.56 
 
 		 216 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  30.87 
 
 		 221 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  32.18 
 
 		 181 aa  90.1  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  31.37 
 
 		 176 aa  89.7  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  35.02 
 
 		 184 aa  89.4  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  34.47 
 
 		 171 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  34.36 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  34.38 
 
 		 174 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  33.03 
 
 		 221 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  32.92 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  30.83 
 
 		 231 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  33.49 
 
 		 216 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  30.09 
 
 		 189 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  30.37 
 
 		 183 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  29.65 
 
 		 169 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.49 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  30.85 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  29.95 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0564  signal peptidase I  33.15 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  33.17 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0578  signal peptidase I  32.58 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>