More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1310 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  100 
 
 
198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  60.1 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  58.08 
 
 
193 aa  240  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  58.08 
 
 
192 aa  240  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  63.79 
 
 
190 aa  236  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  60.23 
 
 
190 aa  231  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  54.74 
 
 
209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  56.99 
 
 
203 aa  216  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  56.21 
 
 
220 aa  195  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  47.96 
 
 
200 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  47.96 
 
 
200 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  47.47 
 
 
214 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  45.1 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  40.62 
 
 
216 aa  164  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  44.79 
 
 
217 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  44.85 
 
 
173 aa  157  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  40.93 
 
 
215 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9241  predicted protein  44 
 
 
178 aa  153  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  41.76 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  45.51 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  44.12 
 
 
186 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  45.1 
 
 
196 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  42.69 
 
 
188 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  42.11 
 
 
188 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  40.37 
 
 
217 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  42.86 
 
 
194 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  40.64 
 
 
199 aa  148  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  47.13 
 
 
173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  41.38 
 
 
194 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  42.6 
 
 
181 aa  145  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  42.31 
 
 
171 aa  145  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  44.38 
 
 
196 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  41.27 
 
 
184 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  45.51 
 
 
194 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  42.68 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  39.89 
 
 
187 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  43.21 
 
 
189 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  47.22 
 
 
373 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  46.81 
 
 
349 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  46.81 
 
 
349 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  38.86 
 
 
208 aa  130  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  38.36 
 
 
206 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  37.78 
 
 
185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  38.5 
 
 
198 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  39.57 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  41.92 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  37.88 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  38.34 
 
 
200 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  35.19 
 
 
234 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  36.36 
 
 
187 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  48.92 
 
 
192 aa  123  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  39.02 
 
 
197 aa  122  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  34.55 
 
 
215 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  37.75 
 
 
230 aa  121  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  34.93 
 
 
219 aa  121  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  41.72 
 
 
179 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  39.41 
 
 
193 aa  121  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  35.64 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  36.04 
 
 
235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  35.32 
 
 
288 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  39.78 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  36.76 
 
 
238 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  48.2 
 
 
186 aa  118  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  38.55 
 
 
183 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  46.27 
 
 
189 aa  118  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  35.96 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  35.15 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  37.8 
 
 
192 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  36.69 
 
 
176 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  35.42 
 
 
267 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05771  Signal peptidase I  36.73 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  40 
 
 
170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  36.27 
 
 
266 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  36.36 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  34.74 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.55 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  37.82 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  34.16 
 
 
219 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  34.16 
 
 
219 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  35.6 
 
 
267 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  35.68 
 
 
219 aa  111  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  41.78 
 
 
271 aa  111  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  32.99 
 
 
225 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  40.38 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  35.29 
 
 
262 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  37.22 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  36.48 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  33.98 
 
 
248 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  33.98 
 
 
248 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  33.51 
 
 
256 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  34.09 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  32.77 
 
 
183 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  35.56 
 
 
184 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  33.89 
 
 
297 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  31.6 
 
 
297 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  34.09 
 
 
183 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  31.6 
 
 
297 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  33.67 
 
 
268 aa  108  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  36.65 
 
 
264 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  46.46 
 
 
248 aa  107  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>