More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0312 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  100 
 
 		 169 aa  343  8e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0578  signal peptidase I  58.9 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0564  signal peptidase I  58.9 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  41.61 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0432  signal peptidase I  41.21 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0849039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0427  Signal peptidase I  41.36 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  41.42 
 
 		 192 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  37.95 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  41.46 
 
 		 192 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  40.12 
 
 		 186 aa  114  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  40.24 
 
 		 189 aa  114  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  36.31 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  35.87 
 
 		 191 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  35.87 
 
 		 191 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  38.55 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  37.65 
 
 		 200 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  37.65 
 
 		 200 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  37.65 
 
 		 198 aa  104  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  36.88 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  38.46 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  37.65 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  37.97 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  38.79 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  34.91 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3441  signal peptidase I  39.55 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  32.18 
 
 		 190 aa  98.2  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  32.75 
 
 		 190 aa  97.8  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  35.39 
 
 		 183 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0024  signal peptidase I  36.61 
 
 		 192 aa  97.4  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  35.39 
 
 		 183 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  35.39 
 
 		 183 aa  97.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  35.39 
 
 		 183 aa  97.4  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  35.39 
 
 		 183 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  35.39 
 
 		 183 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  35.39 
 
 		 183 aa  97.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  36.42 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  33.15 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  31.95 
 
 		 209 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  34.62 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  33.68 
 
 		 268 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  34.83 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  35.96 
 
 		 181 aa  95.1  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  34.94 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  34.27 
 
 		 183 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  36.77 
 
 		 189 aa  94.4  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  36.21 
 
 		 183 aa  94  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  36.21 
 
 		 183 aa  94  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  34.44 
 
 		 220 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  35.43 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  28.71 
 
 		 284 aa  92.4  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34.46 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  35.15 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  30.81 
 
 		 188 aa  91.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  36 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  36 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  36 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  36 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  36 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  36 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  33.73 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  41.5 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  33.33 
 
 		 220 aa  91.3  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  38.93 
 
 		 349 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  38.93 
 
 		 349 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  32.94 
 
 		 174 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.71 
 
 		 199 aa  90.9  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  36 
 
 		 183 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  34.86 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  31.98 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  33.14 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  33.14 
 
 		 183 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  32.53 
 
 		 197 aa  89  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.14 
 
 		 197 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  29.9 
 
 		 267 aa  88.2  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  30.65 
 
 		 207 aa  88.2  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05771  Signal peptidase I  31.87 
 
 		 211 aa  88.2  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0553  signal peptidase IB  36.22 
 
 		 191 aa  87.8  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  34.32 
 
 		 173 aa  87.4  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  34.39 
 
 		 271 aa  86.3  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  28.5 
 
 		 219 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  29.67 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  29.67 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  31.76 
 
 		 182 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  29.67 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  29.65 
 
 		 304 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  33.12 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  29.67 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  26.24 
 
 		 279 aa  85.5  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  35.33 
 
 		 198 aa  85.1  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  29.85 
 
 		 208 aa  84.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  28.77 
 
 		 219 aa  84.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  30.22 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  30.22 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  29.67 
 
 		 187 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  31.94 
 
 		 216 aa  84.7  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  30.22 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  30.22 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  27.36 
 
 		 290 aa  84.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  30.22 
 
 		 187 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  27.4 
 
 		 219 aa  84.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>