More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2877 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  43.15 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  42.77 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  43.12 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  35.71 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  35.75 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  36.52 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  36.52 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  42.01 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  34.39 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  38.32 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  36.9 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  36.13 
 
 		 217 aa  104  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  35.67 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  33.33 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  35.63 
 
 		 193 aa  101  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  36 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  31.41 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1523  signal peptidase I  38.13 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000512014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  39.55 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  31.89 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  36.05 
 
 		 198 aa  98.6  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  33.7 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.8 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  36.21 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  38.1 
 
 		 171 aa  97.1  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  31.35 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  35.84 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  34.84 
 
 		 271 aa  95.5  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  31.75 
 
 		 233 aa  95.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  34.1 
 
 		 173 aa  95.1  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  34.72 
 
 		 221 aa  94.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  36.59 
 
 		 186 aa  94.4  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0206  signal peptidase I  32.76 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678677  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  37.27 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  34.5 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  35.91 
 
 		 173 aa  92.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  33.12 
 
 		 189 aa  92  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  34.78 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1095  signal peptidase I  39.1 
 
 		 248 aa  92  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  36.07 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  36.07 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  34.48 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  34.24 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  34.24 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  34.24 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  34.24 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  34.24 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  34.24 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  34.78 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  34.24 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  32.76 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  31.25 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  34.64 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  34.83 
 
 		 192 aa  89.4  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1741  signal peptidase I  32.63 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0024  signal peptidase I  31.55 
 
 		 192 aa  89  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  36.2 
 
 		 183 aa  88.6  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  32.93 
 
 		 174 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  34.91 
 
 		 187 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  34.91 
 
 		 187 aa  88.2  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  34.91 
 
 		 187 aa  88.2  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  33.92 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  33.92 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  33.92 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  33.33 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  34.08 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  33.92 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  34.68 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  31.55 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  32.95 
 
 		 217 aa  85.9  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  36.59 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  30.98 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  30.98 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  33.73 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  31.76 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  27.27 
 
 		 216 aa  85.1  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  35.33 
 
 		 169 aa  85.1  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  31.71 
 
 		 220 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  34.16 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  34.16 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  34.16 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  34.16 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  29.15 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  34.16 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  35.44 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  34.16 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  30.12 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  34.16 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  34.1 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  34.16 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  30.96 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  35.29 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  33.33 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  32.81 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  30 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  34.16 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0393  signal peptidase I  30.51 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  31.98 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1333  Signal peptidase I  30.05 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>