More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0024 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0024  signal peptidase I  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  53.72 
 
 
191 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  53.72 
 
 
191 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0553  signal peptidase IB  54.92 
 
 
191 aa  192  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  43.09 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  42.02 
 
 
187 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  43.09 
 
 
187 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  42.55 
 
 
187 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  42.55 
 
 
187 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  43.09 
 
 
187 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  43.09 
 
 
187 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  42.55 
 
 
187 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  43.09 
 
 
187 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  42.02 
 
 
187 aa  157  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  42.02 
 
 
187 aa  157  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  43.02 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  44.51 
 
 
182 aa  151  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  40.78 
 
 
183 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  40.78 
 
 
183 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  41.99 
 
 
183 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  42.54 
 
 
183 aa  149  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  44.13 
 
 
184 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  40.22 
 
 
183 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  40.22 
 
 
183 aa  148  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  40.22 
 
 
183 aa  148  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  40.22 
 
 
183 aa  148  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  40.22 
 
 
183 aa  148  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  40.22 
 
 
183 aa  148  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  40.22 
 
 
183 aa  147  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  41.01 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  41.21 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  41.21 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  41.44 
 
 
183 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  41.44 
 
 
183 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  41.44 
 
 
183 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  41.44 
 
 
183 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  41.44 
 
 
183 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  41.44 
 
 
183 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  43.86 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  41.44 
 
 
183 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  43.1 
 
 
186 aa  142  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0400  signal peptidase I  39.01 
 
 
176 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0393  signal peptidase I  40.78 
 
 
177 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  35.16 
 
 
173 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0392  signal peptidase I (SPase I)  39.11 
 
 
178 aa  121  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0528  signal peptidase I S  39.66 
 
 
178 aa  121  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0459  signal peptidase I S  39.11 
 
 
177 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  40.33 
 
 
189 aa  121  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0529  signal peptidase I S  39.11 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  36.6 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0552  signal peptidase IA, inactive  33.88 
 
 
173 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  34.97 
 
 
174 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0790  Signal peptidase I  38.24 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165061  hitchhiker  9.36355e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0388  signal peptidase I  39.11 
 
 
178 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.932746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  34.05 
 
 
173 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4845  signal peptidase I  39.66 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  35.33 
 
 
176 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  32.04 
 
 
172 aa  114  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0478  signal peptidase I  38.51 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0206  signal peptidase I  35.14 
 
 
182 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  36.21 
 
 
184 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  36.61 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2062  Signal peptidase I  34.78 
 
 
201 aa  107  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  33.7 
 
 
185 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  33.88 
 
 
201 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  30.27 
 
 
200 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  35.91 
 
 
187 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  30.27 
 
 
200 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  32.96 
 
 
186 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  31.87 
 
 
185 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  32.2 
 
 
193 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  29.89 
 
 
214 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1741  signal peptidase I  36.04 
 
 
207 aa  102  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0964  signal peptidase I  32.79 
 
 
174 aa  101  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.662422  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0983  signal peptidase I  32.79 
 
 
174 aa  101  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.879608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  32.37 
 
 
189 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  32.39 
 
 
171 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  31.25 
 
 
220 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  33.49 
 
 
271 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2503  signal peptidase I  33.96 
 
 
173 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  28.65 
 
 
190 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  30.86 
 
 
174 aa  99.4  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  31.03 
 
 
233 aa  99  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  31.22 
 
 
220 aa  98.2  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1861  Signal peptidase I  32.46 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0958721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  28.26 
 
 
198 aa  97.8  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  30.26 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2663  signal peptidase I  34.57 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.825053  hitchhiker  0.000150203 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1935  signal peptidase I  34.78 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  27.46 
 
 
220 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  31.18 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  30.43 
 
 
236 aa  95.1  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  27.67 
 
 
248 aa  94.4  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  27.67 
 
 
248 aa  94.4  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  28.72 
 
 
209 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  32.43 
 
 
198 aa  93.6  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1723  signal peptidase I  36.16 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  30.21 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  26.11 
 
 
190 aa  92  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  30.69 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>