More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0427 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0427  Signal peptidase I  100 
 
 
180 aa  363  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0432  signal peptidase I  97.22 
 
 
180 aa  352  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0849039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0578  signal peptidase I  49.32 
 
 
176 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0564  signal peptidase I  49.66 
 
 
176 aa  137  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  41.67 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  39.77 
 
 
187 aa  123  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  41.36 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  40.62 
 
 
173 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  41.67 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  36.36 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  36.26 
 
 
176 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  36.81 
 
 
171 aa  106  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  36.71 
 
 
189 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  41.86 
 
 
197 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  37.65 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  35.29 
 
 
200 aa  98.2  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  35.29 
 
 
200 aa  98.2  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  34.88 
 
 
214 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  36.72 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  37.42 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  40.28 
 
 
220 aa  95.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  34.88 
 
 
191 aa  94.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  35.59 
 
 
189 aa  94.4  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  35.23 
 
 
190 aa  94.4  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  34.81 
 
 
173 aa  94.4  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  32.07 
 
 
190 aa  94  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  35.9 
 
 
186 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  35.19 
 
 
192 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  35.19 
 
 
193 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  32.11 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  29.81 
 
 
215 aa  92.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  33.52 
 
 
194 aa  91.3  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  31.07 
 
 
217 aa  91.3  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  33.52 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  35.44 
 
 
174 aa  90.9  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  31.18 
 
 
198 aa  90.9  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  32.34 
 
 
216 aa  89.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  32.58 
 
 
194 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  35.71 
 
 
185 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  33.9 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  33.9 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  35.35 
 
 
235 aa  87.4  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  38.78 
 
 
349 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  38.78 
 
 
349 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  29.23 
 
 
219 aa  87  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  31.58 
 
 
220 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  34.91 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  32.18 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  31.89 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  33.14 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  33.33 
 
 
196 aa  84.3  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  33.15 
 
 
220 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  30.77 
 
 
268 aa  84  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  29.38 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  30.48 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  35.29 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  31.55 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3441  signal peptidase I  31.06 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101353  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0024  signal peptidase I  33.13 
 
 
192 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2140  signal peptidase I  32.95 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  33.56 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  32.67 
 
 
267 aa  80.9  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  33.56 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  29.41 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  31.73 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3111  signal peptidase I  34.75 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.349413  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  31.14 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3112  Signal peptidase I  31.95 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357382  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  29.31 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  33.16 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  36.3 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  29.03 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0034  signal peptidase I  29.08 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00298728  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  29.95 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  33.33 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  29.26 
 
 
197 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  31.12 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  32.92 
 
 
217 aa  79  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2871  Signal peptidase I  31.36 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2841  signal peptidase I  31.36 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000384139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3086  Signal peptidase I  31.36 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  28.93 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  30.92 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3092  signal peptidase I  31.36 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  32.79 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0400  signal peptidase I  30.51 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  30.81 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2801  signal peptidase I  34.04 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  30.24 
 
 
338 aa  78.2  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  30.73 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  31.95 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3079  signal peptidase I  34.04 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  29.75 
 
 
243 aa  77.4  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  29.32 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  27.8 
 
 
215 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1836  signal peptidase I  36.17 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  34.72 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  29.94 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  33.12 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2156  signal peptidase I  33.33 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>