More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2149 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  92.59 
 
 		 243 aa  464  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  71.5 
 
 		 236 aa  318  6e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  52.47 
 
 		 262 aa  251  9.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  49.49 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  42.71 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  38.29 
 
 		 216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  40.62 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  40.4 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  39.59 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  37.9 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  41.15 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  39.58 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  37.75 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  36.41 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  38.97 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  38.62 
 
 		 173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  40.31 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  38.42 
 
 		 185 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  37.5 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  38.58 
 
 		 173 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  37.56 
 
 		 174 aa  118  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  40.61 
 
 		 170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  39.58 
 
 		 171 aa  116  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  34.13 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  34.93 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  34.93 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  32.89 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34 
 
 		 199 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  37.81 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  35.42 
 
 		 187 aa  112  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  40.59 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  37.44 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  41.14 
 
 		 172 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  35.82 
 
 		 181 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  41.86 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  35.64 
 
 		 197 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  38.32 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  36.46 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  35.42 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  35.42 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  36.23 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  41.73 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  32.04 
 
 		 214 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  39.69 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  35.12 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  37.79 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  32.19 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  33.64 
 
 		 288 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  35.38 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  36.19 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  35.2 
 
 		 192 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  31.28 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  34.11 
 
 		 190 aa  99.4  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  33.33 
 
 		 183 aa  99.4  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  30.05 
 
 		 275 aa  99.4  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  34.31 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  31.22 
 
 		 173 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  33.33 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  33.33 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  32.65 
 
 		 190 aa  98.6  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  33.71 
 
 		 203 aa  98.6  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  39.57 
 
 		 209 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  36.5 
 
 		 189 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  32.69 
 
 		 184 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  32.46 
 
 		 183 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  31.58 
 
 		 187 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  32.46 
 
 		 183 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  32.8 
 
 		 183 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  32.8 
 
 		 183 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  32.8 
 
 		 183 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  32.8 
 
 		 183 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  32.8 
 
 		 183 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  32.8 
 
 		 183 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  32.43 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  31.58 
 
 		 187 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  30.62 
 
 		 187 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  36.14 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  30.62 
 
 		 187 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  36.28 
 
 		 282 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  30.62 
 
 		 187 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  31.1 
 
 		 187 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  34.98 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  36.52 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  33.48 
 
 		 338 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  32.7 
 
 		 267 aa  95.5  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  33.73 
 
 		 216 aa  95.9  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  32.28 
 
 		 183 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  32.78 
 
 		 182 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  33.16 
 
 		 189 aa  95.5  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  31.1 
 
 		 187 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  35.29 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  29.79 
 
 		 274 aa  95.1  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  32.13 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  33.04 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  42.86 
 
 		 185 aa  95.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  30.23 
 
 		 215 aa  95.1  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  34.39 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  31.1 
 
 		 187 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  31.1 
 
 		 187 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>