More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3855 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  100 
 
 
275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3856  signal peptidase I  38.38 
 
 
265 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  35.34 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  41.5 
 
 
198 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  42.86 
 
 
200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  41.92 
 
 
199 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  39.3 
 
 
199 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  39.91 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  33.6 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  38.83 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  39.9 
 
 
206 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  39.61 
 
 
219 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  34.24 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  41.43 
 
 
221 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  35.32 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  40.2 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  38.38 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  41.5 
 
 
220 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  37.27 
 
 
257 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  36.09 
 
 
288 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  37.04 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  40.09 
 
 
299 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  33.33 
 
 
247 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  33.78 
 
 
301 aa  125  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  39.15 
 
 
299 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  40.61 
 
 
171 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  41.03 
 
 
222 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  35.53 
 
 
226 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  30.83 
 
 
247 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  32.18 
 
 
260 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  32.3 
 
 
260 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  32.18 
 
 
260 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  32.18 
 
 
260 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  32.86 
 
 
267 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  34.65 
 
 
214 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  38.78 
 
 
219 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  38.28 
 
 
283 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  34.78 
 
 
322 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  33.2 
 
 
305 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  33.2 
 
 
304 aa  123  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  40 
 
 
322 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  39.2 
 
 
216 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  32.92 
 
 
251 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  37.62 
 
 
240 aa  122  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  33.07 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  34.8 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  36.5 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  34.1 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  41.21 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  35.65 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  38.42 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  38.42 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  38.94 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  32.95 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  30.94 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  37.7 
 
 
190 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  32.33 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  34.48 
 
 
216 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  34.35 
 
 
322 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  32.14 
 
 
305 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  34.31 
 
 
255 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  36.06 
 
 
299 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  32.75 
 
 
305 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  32.14 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  36.09 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  35.42 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  32.14 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  30.83 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  32.14 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  32.14 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  33.17 
 
 
298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  37.04 
 
 
324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  31.95 
 
 
252 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  36.15 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  37.56 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  31.95 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  36.53 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  31.36 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  34.23 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  30.94 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  31.36 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  34.57 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  31.74 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  36.74 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  32.54 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  36.04 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  35.35 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  36.04 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  30.61 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  30.61 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  30.61 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  34.88 
 
 
325 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  31.18 
 
 
252 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  29.88 
 
 
304 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  34.84 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  32.05 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  40 
 
 
268 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  34.55 
 
 
271 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  33.2 
 
 
332 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  33.2 
 
 
332 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>