More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3856 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3856  signal peptidase I  100 
 
 
265 aa  551  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  38.52 
 
 
275 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  36.4 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  37.7 
 
 
199 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  36.53 
 
 
225 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  36.11 
 
 
225 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  32.82 
 
 
240 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  35.94 
 
 
221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  36.49 
 
 
216 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  35.75 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  36.05 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  33.33 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  37.32 
 
 
200 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.32 
 
 
198 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  33.64 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  36.09 
 
 
226 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  38.59 
 
 
220 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  33.06 
 
 
256 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  35.42 
 
 
305 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  35.42 
 
 
305 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  35.42 
 
 
305 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  35.42 
 
 
305 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  31.35 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  35.35 
 
 
216 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  35.75 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  35.75 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  32.23 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  35.68 
 
 
305 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  35.68 
 
 
305 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  35.68 
 
 
305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  35.62 
 
 
222 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  35.04 
 
 
305 aa  119  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  40 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  36.36 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  32.93 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  34.98 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  32.19 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  32.35 
 
 
247 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  36 
 
 
249 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  34.35 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  34.35 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  34.83 
 
 
324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  32.35 
 
 
247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  32.89 
 
 
247 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  32.88 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  33.47 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  32.37 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  34.17 
 
 
297 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  33.02 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  33.33 
 
 
305 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  33.04 
 
 
274 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  33.75 
 
 
297 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  31.16 
 
 
267 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  33.33 
 
 
297 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  33.33 
 
 
297 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  33.33 
 
 
297 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  33.75 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  33.75 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  34.87 
 
 
305 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  35.56 
 
 
304 aa  112  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  34.45 
 
 
305 aa  111  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  35.06 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  34.43 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0943  signal peptidase I  33.47 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  32.28 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  33.33 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  36.97 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  34.62 
 
 
260 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  34.53 
 
 
305 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  30.71 
 
 
252 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  29.96 
 
 
252 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0872  signal peptidase I  33.47 
 
 
282 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0423773  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  32.44 
 
 
187 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  30.49 
 
 
343 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  30.19 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  34.88 
 
 
185 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  30.89 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  29.88 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  31.82 
 
 
297 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  30.34 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  31.82 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  31.82 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  31.82 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  31.82 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  31.82 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  31.82 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  31.82 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  31.18 
 
 
332 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  33.92 
 
 
236 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  33.5 
 
 
186 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  30.71 
 
 
247 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  31.18 
 
 
332 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  32.89 
 
 
305 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  30.5 
 
 
251 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  32.07 
 
 
262 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  31.8 
 
 
267 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  31.18 
 
 
332 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  30.21 
 
 
262 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  32.44 
 
 
305 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  32.59 
 
 
257 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>