More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0491 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  100 
 
 
279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  65.82 
 
 
276 aa  397  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  66.79 
 
 
275 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  64.71 
 
 
276 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  64.79 
 
 
268 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  65.09 
 
 
276 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  63.14 
 
 
289 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  35.89 
 
 
372 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  31.55 
 
 
398 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  33.43 
 
 
364 aa  188  7e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  31.79 
 
 
393 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  28.82 
 
 
517 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  30.65 
 
 
498 aa  172  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  34.8 
 
 
356 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  37.66 
 
 
225 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  36.93 
 
 
216 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  33.96 
 
 
198 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  35.56 
 
 
225 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  30.05 
 
 
378 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34.22 
 
 
200 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  36.14 
 
 
219 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  32.44 
 
 
199 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  38.16 
 
 
270 aa  149  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  36.02 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  39 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  34.16 
 
 
221 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  35.02 
 
 
199 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  34.4 
 
 
216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.69 
 
 
305 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  36.69 
 
 
305 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  36.02 
 
 
248 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  36.02 
 
 
248 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  36.69 
 
 
305 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.69 
 
 
305 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  36.69 
 
 
305 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  36.69 
 
 
305 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  36.44 
 
 
288 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  36.69 
 
 
305 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  35.86 
 
 
222 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  34.03 
 
 
268 aa  142  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  26.98 
 
 
530 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  36.08 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.1 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  37.39 
 
 
256 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  35.77 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  36.05 
 
 
305 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  36.4 
 
 
305 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  37.45 
 
 
274 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  33.73 
 
 
297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  33.73 
 
 
297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  33.73 
 
 
297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  34.25 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  34.13 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  34.13 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  32.94 
 
 
297 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  34.65 
 
 
299 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  35.25 
 
 
226 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  31.12 
 
 
240 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  29.35 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  34.04 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  33.08 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  33.57 
 
 
221 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  33.9 
 
 
214 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  34.87 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  36.24 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  37.05 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  37.61 
 
 
342 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  36.02 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  35.81 
 
 
297 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  36.56 
 
 
304 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  33.2 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  32.74 
 
 
266 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  34.5 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  33.73 
 
 
325 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  36.49 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  36.49 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  36.49 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  33.62 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  36.49 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  32.95 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  36.49 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  36.49 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  35.02 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  35.51 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  32.92 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  35.02 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  36.49 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  35 
 
 
325 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  33.62 
 
 
322 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  34.52 
 
 
305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  34.17 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  34.17 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  35.37 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  32.68 
 
 
269 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  31.65 
 
 
380 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  33.95 
 
 
322 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  36.02 
 
 
297 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  35.4 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  34.48 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  35.63 
 
 
322 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>