More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07095 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  100 
 
 		 530 aa  1082    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  54.95 
 
 		 517 aa  586  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  47.09 
 
 		 517 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  39.61 
 
 		 398 aa  294  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  38.92 
 
 		 378 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  40 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  37.05 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  38.9 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  36.7 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  37.98 
 
 		 372 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  35.73 
 
 		 465 aa  246  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  35.92 
 
 		 498 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  35.75 
 
 		 364 aa  236  6e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  34.2 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  27.34 
 
 		 275 aa  143  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  26.92 
 
 		 276 aa  143  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  26.98 
 
 		 279 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  27.06 
 
 		 276 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  31.23 
 
 		 302 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  26.81 
 
 		 362 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  31.07 
 
 		 289 aa  99  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  26.08 
 
 		 306 aa  94.4  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  40.17 
 
 		 276 aa  92.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  25.54 
 
 		 306 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  38.89 
 
 		 268 aa  91.3  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  27.57 
 
 		 219 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  30.36 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  31.46 
 
 		 216 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  30.73 
 
 		 252 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  28.64 
 
 		 214 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  32.4 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  29.61 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  28.45 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  27.98 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  30.17 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4225  hypothetical protein  41.18 
 
 		 139 aa  80.9  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  30.06 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  33.53 
 
 		 245 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  30.34 
 
 		 259 aa  79.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  27.01 
 
 		 225 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  30.06 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  35.29 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  35.29 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  30.29 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  42.05 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  30.95 
 
 		 216 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  24.55 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  30.12 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  25.97 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1615  signal peptidase I  25.07 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  29.94 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  28.42 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  26.44 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  26.7 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  46.67 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  30.91 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  27.96 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  33.15 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  28.98 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  30.91 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  29.23 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  51.61 
 
 		 263 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  51.61 
 
 		 263 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  25.63 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  50.77 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  30.29 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  51.47 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  50.77 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  29.07 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  50.77 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  50.77 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  50.77 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  29.07 
 
 		 297 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  30.64 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  29.07 
 
 		 297 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  29.07 
 
 		 297 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  30.29 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  28.49 
 
 		 297 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  27.43 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  28.49 
 
 		 297 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  31.02 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  28.57 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  29.17 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  25.46 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  46.97 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  28.96 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  31.01 
 
 		 271 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  50.82 
 
 		 311 aa  69.7  0.0000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  27.78 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  27.6 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  25.58 
 
 		 322 aa  69.3  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  46.88 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  26.37 
 
 		 226 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  27.38 
 
 		 220 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  46.88 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  46.88 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  56.25 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  25.27 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1288  hypothetical protein  41.25 
 
 		 144 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00224193  hitchhiker  0.00309833 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  56.25 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>