More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1810 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  100 
 
 		 517 aa  1055    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  49.32 
 
 		 517 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  47.09 
 
 		 530 aa  474  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  42.2 
 
 		 398 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  40.55 
 
 		 390 aa  289  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  40.37 
 
 		 364 aa  286  7e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  41.51 
 
 		 378 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  40.39 
 
 		 465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  39.29 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  39.02 
 
 		 389 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  42.56 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  37.63 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  36.1 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  34.77 
 
 		 356 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  30.65 
 
 		 268 aa  157  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  28.57 
 
 		 276 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  33.07 
 
 		 302 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  43.26 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  40.83 
 
 		 279 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  39.01 
 
 		 289 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  42.22 
 
 		 275 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  34.34 
 
 		 276 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  27.03 
 
 		 322 aa  97.8  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  25.75 
 
 		 306 aa  94  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  25.75 
 
 		 306 aa  93.6  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  28.25 
 
 		 362 aa  87  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  29.41 
 
 		 225 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  30.49 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  29.8 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  23.56 
 
 		 283 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  23.87 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  28.93 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  28.1 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  31.45 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  34.11 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  27.44 
 
 		 293 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  31.9 
 
 		 259 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  26.74 
 
 		 221 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  28.1 
 
 		 219 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  28.72 
 
 		 220 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  46.05 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  26.05 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  27.83 
 
 		 305 aa  72  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  29.33 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  28.9 
 
 		 198 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  26.8 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  28.85 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  29.87 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  30.67 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  25.16 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  28.85 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  29.87 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  29.22 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  28.57 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  24.89 
 
 		 299 aa  70.1  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  52.46 
 
 		 311 aa  70.1  0.0000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  43.96 
 
 		 256 aa  69.3  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  24.42 
 
 		 216 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  25.33 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  43.96 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  26.92 
 
 		 199 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  28.76 
 
 		 249 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  55.77 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  55.77 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  55.77 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  55.77 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  55.77 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  29.56 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  24.89 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  24.71 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  24.67 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  26.87 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  28.11 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  27.44 
 
 		 268 aa  67  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  26.62 
 
 		 263 aa  67  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  25.82 
 
 		 266 aa  67  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  51.92 
 
 		 324 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  51.92 
 
 		 324 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  51.92 
 
 		 324 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  40.91 
 
 		 305 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  29.93 
 
 		 236 aa  66.2  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  24.16 
 
 		 269 aa  66.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  50.94 
 
 		 324 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  51.92 
 
 		 324 aa  66.6  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0872  signal peptidase I  26.99 
 
 		 282 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0423773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  51.92 
 
 		 324 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  28.66 
 
 		 247 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  51.92 
 
 		 324 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  51.92 
 
 		 324 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  51.92 
 
 		 324 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  28.86 
 
 		 255 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  28.48 
 
 		 278 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  28.75 
 
 		 247 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  61.9 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  26.79 
 
 		 200 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0943  signal peptidase I  26.64 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  52.94 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  61.9 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  27.61 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  50 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>