More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2565 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  54.89 
 
 		 498 aa  290  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  36.93 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  37.82 
 
 		 364 aa  159  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  35.97 
 
 		 390 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  35.43 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  37 
 
 		 465 aa  141  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  32.31 
 
 		 392 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  35.82 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  38.97 
 
 		 393 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  32.94 
 
 		 517 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  28.87 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  33.07 
 
 		 517 aa  116  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  29.02 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  31.23 
 
 		 530 aa  106  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  27.06 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  28.92 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  26.58 
 
 		 356 aa  96.3  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  25.44 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  26.38 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  25.31 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  34.62 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  27.56 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  62.22 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  61.9 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  61.9 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  58.7 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  62.5 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  57.78 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  60.47 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  57.14 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  59.52 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  60 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  60 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  60 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  60 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  59.52 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  60 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  59.52 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  59.52 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  62.5 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  57.78 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  57.78 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  60.98 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  57.78 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  57.78 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  57.78 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  59.52 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  57.78 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  57.78 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  57.14 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  57.78 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  54.55 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  59.52 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  52 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  56.82 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  57.5 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  23.6 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  22.97 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  57.5 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  77.42 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  57.5 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  57.5 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  57.5 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  57.5 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  57.5 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  77.42 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  54.76 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  22.53 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  45.9 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  45.9 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  75 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  77.42 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  57.5 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  57.5 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  58.97 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  74.19 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  75 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  53.33 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  68.57 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  64.86 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  47.83 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  46.88 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  50 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  27.98 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  57.14 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>