More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0245 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  100 
 
 		 390 aa  804    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  69.41 
 
 		 389 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  62.04 
 
 		 378 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  57.14 
 
 		 392 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  43.52 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  46.61 
 
 		 498 aa  332  6e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  43.24 
 
 		 398 aa  295  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  43.92 
 
 		 393 aa  289  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  40.55 
 
 		 517 aa  289  7e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  38.31 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  39.02 
 
 		 517 aa  260  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  37.05 
 
 		 530 aa  257  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  38.42 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  35.39 
 
 		 356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  35.97 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  27.87 
 
 		 362 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  37.08 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  46.38 
 
 		 268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  46.28 
 
 		 289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  44.44 
 
 		 276 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  43.36 
 
 		 276 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  45 
 
 		 275 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  42.96 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  26.33 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  31.62 
 
 		 216 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  35 
 
 		 225 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  31.84 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  30.33 
 
 		 221 aa  92.8  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  30.34 
 
 		 219 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  33.75 
 
 		 225 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0831  signal peptidase I  26.67 
 
 		 301 aa  90.9  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  29.58 
 
 		 220 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  30.15 
 
 		 219 aa  89.7  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  32.05 
 
 		 240 aa  89  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  31 
 
 		 216 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  33.12 
 
 		 214 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  30.96 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  29.5 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  35.33 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  32.69 
 
 		 247 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1615  signal peptidase I  34.16 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  34 
 
 		 252 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  32.69 
 
 		 247 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  34.84 
 
 		 222 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  32.54 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  29.27 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  24.12 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  35.29 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  32.72 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  29.76 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  24.41 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  33.74 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  33.33 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  32.05 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  31.79 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  33.82 
 
 		 260 aa  79.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  28.16 
 
 		 199 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  52.31 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  52.31 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  31.1 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  33.54 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  30.59 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  30 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  50.77 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  52.31 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  31.1 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  33.33 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  52.31 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  52.31 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  32.74 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  30.59 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  33.54 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  30.59 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  30.59 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  30.59 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  32.67 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  30.59 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  30.59 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  29.75 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0582  signal peptidase I  35.07 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.359862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  51.56 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  32.48 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2245  signal peptidase I  34.46 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2333  signal peptidase I  34.46 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453212  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  33.57 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  30.99 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  30.63 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  50 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  50 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  50 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  30.43 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  27.32 
 
 		 200 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  30.67 
 
 		 198 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0800  signal peptidase I  31.1 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  30.92 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  33.58 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  30.99 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  32.64 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  30 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  31.58 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>