More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2001 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  100 
 
 		 465 aa  961    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  44.14 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  41.22 
 
 		 393 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  40.15 
 
 		 392 aa  293  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  40.64 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  40.39 
 
 		 517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  38.31 
 
 		 390 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  39.11 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  36.84 
 
 		 389 aa  263  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  36.75 
 
 		 498 aa  252  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  35.68 
 
 		 364 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  35.73 
 
 		 530 aa  246  9e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  37.27 
 
 		 372 aa  224  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  32.11 
 
 		 356 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  37 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  37.34 
 
 		 279 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  24.57 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  47.71 
 
 		 268 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  23.34 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  44.35 
 
 		 276 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  40.58 
 
 		 276 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  42.59 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  39.84 
 
 		 289 aa  94  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  39.23 
 
 		 276 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  25.43 
 
 		 332 aa  90.5  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  25.43 
 
 		 332 aa  90.1  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  25.18 
 
 		 332 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  21.54 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  23.1 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  24.53 
 
 		 306 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  57.89 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  51.56 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  50.77 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  50.77 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  50.77 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  50.77 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  50.77 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0844  signal peptidase I  26.69 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  48.48 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  57.41 
 
 		 311 aa  73.2  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  51.67 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  54.55 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  27.81 
 
 		 253 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  55.77 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  55.77 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  50.91 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  55.77 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  55.77 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  55.77 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  55.77 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  55.77 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  55.77 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  55.77 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  27.75 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  55.77 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  66.67 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  55.77 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  55.77 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  56.6 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  55.77 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  55.77 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  55.77 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  28.99 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  54.72 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  28.57 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  67.44 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  54.72 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  75.68 
 
 		 305 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  23.73 
 
 		 324 aa  67  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  54.9 
 
 		 305 aa  67  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  45.21 
 
 		 298 aa  67  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  70 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  28.57 
 
 		 247 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  47.22 
 
 		 299 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  26.7 
 
 		 247 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  51.92 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  66.67 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  51.92 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  22.75 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  62.22 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  39.53 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  62.79 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  62.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  27.38 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  62.79 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  65.85 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>