More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4719 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  100 
 
 		 389 aa  804    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  69.41 
 
 		 390 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  56.33 
 
 		 378 aa  448  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  54.45 
 
 		 392 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  42.67 
 
 		 364 aa  334  2e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  43.34 
 
 		 498 aa  323  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  41.48 
 
 		 398 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  40.37 
 
 		 517 aa  266  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  39.02 
 
 		 517 aa  266  7e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  41.19 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  36.84 
 
 		 465 aa  263  4.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  39.43 
 
 		 372 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  36.7 
 
 		 530 aa  255  8e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  34.68 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  35.43 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  27.64 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  41.84 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  35.05 
 
 		 279 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  36.59 
 
 		 276 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  35.08 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  42.5 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  37.27 
 
 		 276 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  26.49 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  26.49 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  26.49 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  26.49 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  26.49 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  26.49 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  26.49 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  26.49 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  41.32 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  33.14 
 
 		 225 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  36.48 
 
 		 216 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  35.29 
 
 		 216 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  32.4 
 
 		 268 aa  92  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  31.36 
 
 		 219 aa  89.4  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  32.68 
 
 		 225 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  34.42 
 
 		 221 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  32.91 
 
 		 249 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  33.94 
 
 		 219 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  33.72 
 
 		 340 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  30.92 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  33.33 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  30.57 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  33.55 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  33.33 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  34.19 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  25.36 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  25.07 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  32.9 
 
 		 252 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  33.12 
 
 		 252 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  31.54 
 
 		 199 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  31.51 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  33.33 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  30.11 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  29.44 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  30.46 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  32.89 
 
 		 252 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  28.98 
 
 		 279 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  29.76 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  32.08 
 
 		 221 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  31.08 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  32.21 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  32.21 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  31.97 
 
 		 200 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  28.21 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  30 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  53.85 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  53.85 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  52.31 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  53.85 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  53.85 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  53.85 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  30.52 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  36.36 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  29.05 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  30.38 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  31.61 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  30.87 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  29.82 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  31.37 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  28.03 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  29.11 
 
 		 263 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  30.87 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  31.9 
 
 		 245 aa  75.5  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  31.41 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  30.57 
 
 		 199 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  27.8 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  48 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  35.34 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  31.82 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  50 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0582  signal peptidase I  35.34 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.359862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  33.55 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0800  signal peptidase I  31.72 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  29.73 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  30.3 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  30.3 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  30.2 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  29.27 
 
 		 321 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>