More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3528 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  100 
 
 		 398 aa  823    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  52.13 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  44.14 
 
 		 465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  43.72 
 
 		 517 aa  316  4e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  43.26 
 
 		 392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  44.16 
 
 		 378 aa  305  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  42.2 
 
 		 517 aa  302  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  43.24 
 
 		 390 aa  295  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  39.61 
 
 		 530 aa  294  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  41.48 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  39.79 
 
 		 498 aa  268  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  36.41 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  35.61 
 
 		 364 aa  256  7e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  33.68 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  31.55 
 
 		 279 aa  189  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  30.81 
 
 		 276 aa  179  8e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  30.77 
 
 		 275 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  29.64 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  28.64 
 
 		 276 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  35.82 
 
 		 302 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  34.72 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  38.73 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  26.54 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  27.23 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  25.77 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  25.96 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  25.77 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  25.77 
 
 		 332 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  25.6 
 
 		 362 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  25.96 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  25.51 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  25.86 
 
 		 322 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  26.86 
 
 		 324 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  28.1 
 
 		 324 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  26.69 
 
 		 311 aa  97.4  4e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  27.99 
 
 		 324 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  27.99 
 
 		 324 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  27.99 
 
 		 324 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  27.99 
 
 		 324 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  27.99 
 
 		 324 aa  96.7  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  27.99 
 
 		 324 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  27.99 
 
 		 324 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  23.8 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  26.68 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  24.59 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  29.85 
 
 		 240 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  30.6 
 
 		 225 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  26.47 
 
 		 306 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  26.2 
 
 		 306 aa  87  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  24.36 
 
 		 301 aa  86.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  32.39 
 
 		 216 aa  86.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  31.76 
 
 		 219 aa  86.3  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  24.09 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  29.51 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  31.82 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  31.38 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  28.57 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  29.38 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  54.29 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  54.29 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  54.29 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  54.29 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  28.81 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  54.29 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  29.79 
 
 		 263 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  29.53 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  29.14 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  24.17 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  29.69 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  29.69 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  29.69 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  30.32 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  29.55 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  29.41 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  30.17 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  29.69 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  29.69 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  29.69 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  27.08 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1615  signal peptidase I  28.02 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  25.48 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  55.38 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  31.11 
 
 		 250 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  29.44 
 
 		 260 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  30.43 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  28.33 
 
 		 247 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  27.51 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  29.44 
 
 		 260 aa  72.8  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  27.43 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  26.89 
 
 		 249 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  28.33 
 
 		 247 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  26.26 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  30.43 
 
 		 262 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  28.88 
 
 		 324 aa  72  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  29.26 
 
 		 245 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  32.78 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  56.86 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  27.78 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  28.09 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  28.33 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>