More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2042 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  100 
 
 		 356 aa  712    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  51.17 
 
 		 372 aa  326  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  36.96 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  35.64 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  35.58 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  34.25 
 
 		 517 aa  226  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  35.47 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  34.46 
 
 		 530 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  34.77 
 
 		 517 aa  215  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  33.68 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  35.01 
 
 		 364 aa  212  9e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  32.66 
 
 		 498 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  33.42 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  31.49 
 
 		 465 aa  195  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  34.8 
 
 		 279 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  33.04 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  42.96 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  27.62 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  40.14 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  28.4 
 
 		 305 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  29.9 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  28.62 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  28.57 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  28.62 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  38.73 
 
 		 275 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  40.85 
 
 		 276 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  28.24 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  28.62 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  27.13 
 
 		 283 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  37.27 
 
 		 219 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  42.14 
 
 		 219 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  27.33 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  29.81 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0943  signal peptidase I  28.05 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  40.85 
 
 		 221 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  39.35 
 
 		 268 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  36.42 
 
 		 225 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0872  signal peptidase I  28.05 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0423773  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0800  signal peptidase I  25.36 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  39.38 
 
 		 216 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  26.58 
 
 		 302 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  29.32 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  37.75 
 
 		 225 aa  99.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  26.2 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  38.79 
 
 		 221 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  29.17 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  28.71 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  28.71 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  28.71 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  28.71 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  28.71 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  26.2 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  26.2 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  38.19 
 
 		 216 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  40.58 
 
 		 214 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  40 
 
 		 199 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  26.02 
 
 		 268 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  26.02 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  26.02 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  37.06 
 
 		 240 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  27.5 
 
 		 325 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  40 
 
 		 220 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  43.94 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  27.83 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  27.83 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  27.83 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  27.83 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  27.83 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  39.47 
 
 		 198 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  27.83 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  27.83 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  27.83 
 
 		 324 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  40 
 
 		 297 aa  92.8  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  39.87 
 
 		 222 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  39.33 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  39.33 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  39.33 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  39.33 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  39.33 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  39.33 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  28.52 
 
 		 269 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  38.81 
 
 		 200 aa  90.1  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  27.61 
 
 		 381 aa  89.7  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  39.42 
 
 		 199 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  45.74 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  27.12 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  38.97 
 
 		 293 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  38.37 
 
 		 263 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1615  signal peptidase I  46.97 
 
 		 339 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  39.72 
 
 		 226 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  41.88 
 
 		 256 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  40.16 
 
 		 262 aa  86.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  36.36 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2333  signal peptidase I  46.97 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453212  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2245  signal peptidase I  46.97 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  38.41 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  40.65 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0831  signal peptidase I  23.62 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  35.29 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  36.43 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>