More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1140 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  43.07 
 
 		 267 aa  161  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  44.39 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  45.96 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  45.55 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  42.64 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  42.64 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  39.73 
 
 		 284 aa  157  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  45.03 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  38.84 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  44.61 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  43.94 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  42.56 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  40.35 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  41.38 
 
 		 274 aa  154  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  38.39 
 
 		 284 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  47.15 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  39.82 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  38.39 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  37.95 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  38.39 
 
 		 284 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  38.39 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  37.95 
 
 		 284 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  37.95 
 
 		 284 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  38.39 
 
 		 284 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  41.58 
 
 		 270 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  40.1 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  40.49 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  39.81 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  37.9 
 
 		 301 aa  148  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  39.59 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  43.69 
 
 		 298 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  36.74 
 
 		 322 aa  146  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  38.14 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  42.05 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  36.92 
 
 		 297 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  37.38 
 
 		 297 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  40.74 
 
 		 299 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  36.92 
 
 		 297 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  36.92 
 
 		 297 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  36.92 
 
 		 297 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  38.6 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  37.96 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  37.5 
 
 		 297 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  39.25 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  39.8 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  38.79 
 
 		 305 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  36.45 
 
 		 297 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  36.45 
 
 		 297 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  39.44 
 
 		 305 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  39.15 
 
 		 305 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  41.75 
 
 		 299 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  37.25 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  37.39 
 
 		 305 aa  141  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  40.8 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  38.57 
 
 		 305 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  38.57 
 
 		 305 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  37.62 
 
 		 305 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  38.61 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  39.44 
 
 		 305 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  39.44 
 
 		 305 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  39.44 
 
 		 305 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  38.61 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  39.44 
 
 		 305 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  41.29 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  34.86 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  37.56 
 
 		 304 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  39.02 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  43 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  38.21 
 
 		 305 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  41.21 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  38.58 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  36.92 
 
 		 325 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  38.1 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  41.9 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  36.57 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  42.13 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  38.71 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  37.44 
 
 		 342 aa  138  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  40 
 
 		 325 aa  138  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  37.96 
 
 		 325 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  37.74 
 
 		 305 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  41.62 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  40.87 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  39.9 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  42.42 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  34.69 
 
 		 321 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  37.85 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  37.02 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  35.05 
 
 		 322 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  35.98 
 
 		 321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  37.61 
 
 		 301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  40.5 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  42.18 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  34.43 
 
 		 321 aa  135  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  37.26 
 
 		 304 aa  135  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  35.05 
 
 		 322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  42.86 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  39.38 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  37.32 
 
 		 310 aa  134  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>