More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0250 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  100 
 
 
197 aa  390  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  48.78 
 
 
173 aa  157  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  41.14 
 
 
186 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  39.41 
 
 
173 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  45.28 
 
 
187 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  41.53 
 
 
214 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  43.58 
 
 
190 aa  141  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  47.56 
 
 
173 aa  141  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  44.31 
 
 
220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  43.24 
 
 
190 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  43.26 
 
 
220 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  43.02 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  41.4 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  45.34 
 
 
174 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  42.42 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  42.42 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  42.29 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  42.33 
 
 
185 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  36.32 
 
 
338 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  41.48 
 
 
199 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  42.29 
 
 
200 aa  130  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  37.69 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  38.95 
 
 
216 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  41.11 
 
 
221 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  42.7 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  39.7 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  39.32 
 
 
290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  44.79 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  43.86 
 
 
193 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  38.42 
 
 
183 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  38.97 
 
 
248 aa  125  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  38.97 
 
 
248 aa  125  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  35.64 
 
 
216 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  43.17 
 
 
225 aa  124  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  39.6 
 
 
289 aa  124  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  43.31 
 
 
206 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  38.89 
 
 
209 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  38.86 
 
 
184 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  39.02 
 
 
198 aa  123  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  39.39 
 
 
176 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  44.67 
 
 
203 aa  122  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  41.89 
 
 
172 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  41.99 
 
 
225 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  40.57 
 
 
188 aa  122  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  35.4 
 
 
291 aa  121  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  37.44 
 
 
221 aa  121  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  40.12 
 
 
181 aa  121  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  41.38 
 
 
216 aa  121  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  43.41 
 
 
434 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  39.82 
 
 
266 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  41.01 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  44.31 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  40.13 
 
 
184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  38.17 
 
 
215 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  40.27 
 
 
189 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  35.05 
 
 
219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  37.36 
 
 
189 aa  118  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  41.34 
 
 
352 aa  117  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  36.67 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  39.76 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  39.46 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  39.36 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  37.86 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  36.11 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  36.12 
 
 
291 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  38.57 
 
 
297 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  38.05 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  33.04 
 
 
240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  36.11 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  38.57 
 
 
297 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  37.22 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  38.1 
 
 
297 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  38.1 
 
 
297 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  40 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  38.1 
 
 
297 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  39.78 
 
 
186 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  37.33 
 
 
263 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  37.06 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  35.42 
 
 
294 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  38.1 
 
 
297 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  38.1 
 
 
297 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  38.95 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  43.56 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  39.89 
 
 
304 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  35.56 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  35.56 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  40.86 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  35.56 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  35.56 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  34.8 
 
 
274 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  35.56 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  38.07 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  35.56 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  35.23 
 
 
189 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  35.96 
 
 
183 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  42.26 
 
 
199 aa  112  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  40.32 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  36.93 
 
 
183 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  38.86 
 
 
219 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  36.41 
 
 
236 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>