More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3523 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  100 
 
 		 243 aa  490  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  92.59 
 
 		 243 aa  464  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  70.39 
 
 		 236 aa  311  4.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  52.11 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  51.89 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  41.7 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  39.19 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  40.3 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  41.41 
 
 		 199 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  39.45 
 
 		 225 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  41.15 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  37.33 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  43.82 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  41.21 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  40 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  38.07 
 
 		 174 aa  121  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  37.02 
 
 		 185 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  39.68 
 
 		 173 aa  121  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  39.09 
 
 		 173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.99 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  36.68 
 
 		 198 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  42.17 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  37.82 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  40.1 
 
 		 171 aa  116  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  35.82 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  34.8 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  38.12 
 
 		 222 aa  111  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  38.02 
 
 		 197 aa  111  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  34.93 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  34.93 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  33.01 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  34.9 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  38.31 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  39.07 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  35.82 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  37.31 
 
 		 184 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  38.92 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  43.85 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  43.17 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  43.85 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  33.01 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  39.2 
 
 		 172 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  40.72 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  36.1 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  34.58 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  31.46 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  35.9 
 
 		 186 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  34.83 
 
 		 183 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  33.76 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  33.76 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  40.29 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  33.79 
 
 		 217 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  36.67 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  32.9 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  34.36 
 
 		 190 aa  99  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  32.72 
 
 		 288 aa  99  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  36.16 
 
 		 206 aa  99  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  34.83 
 
 		 203 aa  98.6  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  34.2 
 
 		 192 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  35.75 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  31.71 
 
 		 173 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  38 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  44.54 
 
 		 185 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  33.64 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  34.8 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  35.45 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  32.5 
 
 		 189 aa  95.5  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  34.47 
 
 		 338 aa  95.5  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  34.26 
 
 		 262 aa  95.1  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  39.69 
 
 		 184 aa  94.7  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  33.94 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  39.47 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  29.91 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  32.12 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  32.12 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  32.12 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  32.12 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  32.12 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  32.63 
 
 		 184 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  33.79 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  35.48 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  32.12 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  35.02 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  32.7 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  33.73 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  31.5 
 
 		 187 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  34.39 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  32.59 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  32.27 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  31.79 
 
 		 183 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  31.79 
 
 		 183 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  35.02 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  35.02 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  34.8 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  33.17 
 
 		 192 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  34.21 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  35.02 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  35.02 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>