More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0350 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  53.98 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  55.09 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  53.66 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  44.02 
 
 		 186 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  46.79 
 
 		 187 aa  154  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  42.17 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  41.95 
 
 		 174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  46.75 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  44.19 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  41.57 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  45.22 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  45.22 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  41.32 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0427  Signal peptidase I  41.67 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  41.51 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0432  signal peptidase I  43.02 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0849039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  42.42 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  40.8 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  43.14 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  36.56 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  40.83 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  34.97 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  37.58 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  38.06 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  44.37 
 
 		 170 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  36.41 
 
 		 216 aa  124  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  41.61 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  37.79 
 
 		 199 aa  120  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  34.54 
 
 		 190 aa  118  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  33.16 
 
 		 216 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  35.88 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  41.25 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  36.36 
 
 		 221 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  33.33 
 
 		 219 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  36.99 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0564  signal peptidase I  43.86 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  40.98 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  31.22 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  41.29 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0578  signal peptidase I  42.69 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  37.82 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  37.29 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  32.62 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  35.43 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  36.07 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  35.17 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  40.85 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  40 
 
 		 179 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34.41 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  35.03 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  33.01 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  32.98 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  32.68 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  41.86 
 
 		 243 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  31.43 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  33.33 
 
 		 221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  32.68 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  37.87 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  35.15 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  31.02 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  40 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  37.42 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  39.72 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  36.31 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  31.66 
 
 		 233 aa  104  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  35.58 
 
 		 220 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  37.28 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  37.28 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  37.28 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  37.28 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  35.2 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  33.5 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  37.28 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  37.28 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  33.64 
 
 		 341 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  39.51 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  36.09 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2462  signal peptidase I  35.64 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  36.13 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  40.61 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  32.8 
 
 		 275 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  37.28 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0552  signal peptidase IA, inactive  32.14 
 
 		 173 aa  102  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  32.99 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  30 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  40.49 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  38.89 
 
 		 214 aa  101  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  39.53 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  34.88 
 
 		 226 aa  101  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  38.46 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  35.63 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  29.13 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  29.13 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  33.17 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  34.74 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  30.7 
 
 		 270 aa  98.6  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  37.97 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  32.02 
 
 		 247 aa  98.2  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  30.48 
 
 		 313 aa  98.2  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>