More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1149 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  49.41 
 
 		 200 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  49.41 
 
 		 200 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  48.26 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  45.98 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  42.29 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  44.38 
 
 		 209 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  44.31 
 
 		 192 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  44.31 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  48.39 
 
 		 196 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  45.51 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  42.6 
 
 		 198 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  44.91 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  43.26 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  43.67 
 
 		 189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  41.67 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  42.77 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  39.79 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  40.84 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  44.64 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  44.12 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  40.91 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  43.75 
 
 		 173 aa  138  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  40.93 
 
 		 221 aa  137  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  41.95 
 
 		 199 aa  136  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  41.32 
 
 		 193 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  42.5 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  43.48 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  42.86 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  40 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  40 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  39.47 
 
 		 220 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  37.7 
 
 		 221 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  40.88 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  39.55 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  40.88 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  39.57 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  48.92 
 
 		 373 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  40.33 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  39.58 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  39.33 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  44.37 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  39.44 
 
 		 214 aa  127  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  39.23 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  39.52 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  39.52 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  42.68 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  42.59 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  38.8 
 
 		 219 aa  124  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  39.88 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.85 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  40 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  38.55 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.57 
 
 		 198 aa  121  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  48.91 
 
 		 349 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  48.91 
 
 		 349 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  41.21 
 
 		 222 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  40.12 
 
 		 197 aa  120  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  39.77 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  44.23 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  38.95 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9241  predicted protein  37.87 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  35.38 
 
 		 338 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  37.82 
 
 		 213 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  36.17 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  37.7 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  39.34 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  39.01 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  40.68 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  39.01 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  35.82 
 
 		 236 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  36.67 
 
 		 313 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  39.39 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  37.16 
 
 		 360 aa  111  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  34.7 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  37.91 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  37.91 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  37.91 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  37.91 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  37.91 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  34.27 
 
 		 290 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  37.91 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  33.8 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  35.51 
 
 		 291 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  38.8 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  42.37 
 
 		 434 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  35.82 
 
 		 243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  40.97 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  32.35 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  37.91 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  33.18 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  33.79 
 
 		 219 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  35.78 
 
 		 291 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  35.82 
 
 		 243 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  37 
 
 		 352 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  39.78 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  35.36 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  35.68 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  34.11 
 
 		 341 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  38.22 
 
 		 206 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>