More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1121 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  73.47 
 
 
217 aa  300  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  57.84 
 
 
188 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  57.84 
 
 
188 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  63.21 
 
 
206 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  54.64 
 
 
196 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  52.91 
 
 
194 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  52.05 
 
 
194 aa  203  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  52.63 
 
 
194 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  48.86 
 
 
194 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  45.79 
 
 
192 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  47.75 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  50.85 
 
 
209 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  45.45 
 
 
197 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  45.86 
 
 
190 aa  160  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  45.06 
 
 
198 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  48.21 
 
 
220 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  43.53 
 
 
214 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  50.6 
 
 
190 aa  157  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  46.47 
 
 
181 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  40.66 
 
 
173 aa  147  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  50 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  44.51 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  44.51 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  41.36 
 
 
189 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9241  predicted protein  41.76 
 
 
178 aa  139  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  39.47 
 
 
215 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  42.77 
 
 
199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  39.55 
 
 
220 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  41.81 
 
 
171 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  34.74 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  35.45 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  33.86 
 
 
373 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  35.03 
 
 
217 aa  121  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  40.57 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  39.87 
 
 
349 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  39.87 
 
 
349 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  36.31 
 
 
176 aa  118  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  38.35 
 
 
234 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  38.15 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  43.64 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  34.88 
 
 
173 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  33.93 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  36.11 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  35.11 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  35.52 
 
 
173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  39.31 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  37.24 
 
 
225 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  34.91 
 
 
185 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  37.04 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  36.61 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  35.71 
 
 
225 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  34.58 
 
 
268 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34.78 
 
 
199 aa  104  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  38.55 
 
 
191 aa  103  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  35.23 
 
 
219 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  35.42 
 
 
434 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  34.12 
 
 
230 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  33.72 
 
 
183 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  34.11 
 
 
238 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  34.03 
 
 
215 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  33.97 
 
 
219 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  35.42 
 
 
352 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  36.45 
 
 
267 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  34.5 
 
 
192 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  39.15 
 
 
274 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  34.6 
 
 
231 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  34.15 
 
 
255 aa  99.8  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  35.54 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  34.58 
 
 
235 aa  99.4  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  33.85 
 
 
220 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  36.41 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  32.86 
 
 
262 aa  99  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  32.42 
 
 
183 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  34.62 
 
 
183 aa  99  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  36.6 
 
 
216 aa  99  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  36.6 
 
 
170 aa  98.6  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  34.92 
 
 
221 aa  98.6  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  33.49 
 
 
219 aa  98.6  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  28.95 
 
 
193 aa  98.2  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05771  Signal peptidase I  33.01 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  32.94 
 
 
186 aa  98.2  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  31.87 
 
 
183 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  31.87 
 
 
183 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  31.87 
 
 
183 aa  98.2  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  31.87 
 
 
183 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  31.87 
 
 
183 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  31.87 
 
 
183 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  37.06 
 
 
222 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  35.19 
 
 
284 aa  96.7  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  34.5 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  36.65 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  36.36 
 
 
263 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  32.8 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  31.8 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  33.49 
 
 
219 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  31.32 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  37.75 
 
 
284 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  31.32 
 
 
183 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  35.55 
 
 
279 aa  95.5  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>