More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1310 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  100 
 
 		 289 aa  566  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  81.6 
 
 		 290 aa  424  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  56.96 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  45.34 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  44.58 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  44.59 
 
 		 360 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  41.03 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  42.5 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  45.97 
 
 		 434 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  46.47 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  43.95 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  45.11 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  43.35 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  42.53 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  42.92 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  40.52 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  41.3 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  36.43 
 
 		 341 aa  165  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  42.04 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  40.74 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  42.06 
 
 		 279 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  38.31 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  38.43 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  42.49 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  38.96 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  44.29 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  39.48 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  40.16 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  36.78 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  38.36 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  38.59 
 
 		 469 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  39.53 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  37.5 
 
 		 225 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  33.71 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  43.81 
 
 		 251 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  40.51 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  36.89 
 
 		 209 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  38.91 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  34.82 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  39.6 
 
 		 197 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  36.94 
 
 		 214 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  38.33 
 
 		 225 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  37.68 
 
 		 190 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  36.49 
 
 		 200 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  36.49 
 
 		 200 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  36.48 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  31.89 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  33.2 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  33.2 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  33.2 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  38.18 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  32.05 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  36.19 
 
 		 209 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  36.53 
 
 		 199 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  33.19 
 
 		 216 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  32.86 
 
 		 183 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  32.34 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  37.02 
 
 		 173 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  32.86 
 
 		 183 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  32.86 
 
 		 183 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  32.86 
 
 		 183 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  32.86 
 
 		 183 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  32.86 
 
 		 183 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  40.2 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  32.86 
 
 		 183 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  33.33 
 
 		 183 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  32.86 
 
 		 183 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  32.86 
 
 		 183 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  33.8 
 
 		 181 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  38.1 
 
 		 171 aa  109  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  36.84 
 
 		 238 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  38.03 
 
 		 219 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  33.49 
 
 		 187 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  32.39 
 
 		 183 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  33.33 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  36.36 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  32.47 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  35.78 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  34.89 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  37.2 
 
 		 190 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  35.35 
 
 		 234 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  36.57 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  37.75 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  36.1 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  33.65 
 
 		 193 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  34.04 
 
 		 215 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  35.35 
 
 		 208 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  34.88 
 
 		 174 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  35.19 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  32.93 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  35.51 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  37.79 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  35 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  35.18 
 
 		 342 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  30.52 
 
 		 198 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  37.11 
 
 		 199 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  30.92 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  34.26 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  33.18 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  31.15 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>