More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2188 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  100 
 
 
230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  66.81 
 
 
261 aa  283  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  55.5 
 
 
213 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  55.02 
 
 
213 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  48.68 
 
 
360 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  48.1 
 
 
291 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  51.46 
 
 
289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  41.15 
 
 
291 aa  187  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  47.33 
 
 
269 aa  184  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  47.89 
 
 
209 aa  181  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  45.22 
 
 
313 aa  178  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  41.28 
 
 
304 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  41.87 
 
 
338 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  43.7 
 
 
352 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  39.3 
 
 
290 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  38.96 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  43.28 
 
 
434 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  46.26 
 
 
220 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  36.05 
 
 
272 aa  148  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  39.01 
 
 
469 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  38.49 
 
 
268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  36.91 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  38.96 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  39.57 
 
 
311 aa  136  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  35.98 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  37.92 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  36.12 
 
 
299 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  36.51 
 
 
286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  35.57 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  35.54 
 
 
284 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  35.81 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  34.52 
 
 
284 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  34.52 
 
 
284 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  34.52 
 
 
284 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  36.29 
 
 
290 aa  128  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  37.5 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  34.16 
 
 
304 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  37.63 
 
 
174 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  37.81 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  32.48 
 
 
266 aa  118  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  38.46 
 
 
184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  37.07 
 
 
185 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  38.16 
 
 
188 aa  115  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  36.82 
 
 
216 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  39.27 
 
 
173 aa  114  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  33.33 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  32.69 
 
 
309 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  35.92 
 
 
254 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  34.3 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  36.68 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  35.1 
 
 
190 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  36.79 
 
 
216 aa  108  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  35.61 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  34.93 
 
 
200 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  35.32 
 
 
186 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  34.93 
 
 
200 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  36.74 
 
 
216 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  36.18 
 
 
225 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  36.41 
 
 
219 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  35.02 
 
 
247 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34.87 
 
 
199 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  35.53 
 
 
181 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  32.88 
 
 
225 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  35.94 
 
 
262 aa  104  9e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  34.48 
 
 
215 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  33.33 
 
 
192 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  36.32 
 
 
199 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  33.04 
 
 
221 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  34.25 
 
 
253 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  36.13 
 
 
220 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  34.36 
 
 
220 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  36.36 
 
 
183 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  33.66 
 
 
214 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  34.85 
 
 
189 aa  101  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  37.43 
 
 
197 aa  101  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  34.57 
 
 
193 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  32.56 
 
 
214 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  32.55 
 
 
290 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  34.57 
 
 
220 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  35.35 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  35.35 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  35.35 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  35.35 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  35.35 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  35.79 
 
 
342 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  38.98 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  35.35 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  34.38 
 
 
285 aa  99.4  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  33.97 
 
 
262 aa  99  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  31.43 
 
 
197 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  30.77 
 
 
299 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  35.35 
 
 
183 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  32.29 
 
 
217 aa  99  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4299  signal peptidase I  37.7 
 
 
229 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.826182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  36.16 
 
 
189 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  34.63 
 
 
191 aa  98.6  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  36.18 
 
 
183 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  34.95 
 
 
187 aa  97.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  35.64 
 
 
200 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  33.62 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>