More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1023 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  57.42 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  53.4 
 
 		 216 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  41.11 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  43.75 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  39.22 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  42.86 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  40.93 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  36.4 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  37.24 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  44.78 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  38.16 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  43.37 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  46.07 
 
 		 243 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  39.71 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  35.34 
 
 		 291 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  40.2 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  37.13 
 
 		 469 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  41.88 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  40.86 
 
 		 209 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  43.09 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  38.8 
 
 		 289 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  34.13 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  40.66 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  36.99 
 
 		 360 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  40.76 
 
 		 220 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  37.26 
 
 		 304 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  39.44 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  38.67 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  31.05 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  37.78 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  37.36 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  35.37 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  38.24 
 
 		 189 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  40 
 
 		 171 aa  102  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  33.8 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  35.68 
 
 		 190 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  33.68 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  37 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  36.16 
 
 		 190 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  35.02 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  34.31 
 
 		 217 aa  99  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  33.48 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  35.86 
 
 		 225 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  32.89 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  33.52 
 
 		 219 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  33.33 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  34.25 
 
 		 198 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  37.08 
 
 		 220 aa  96.3  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  34.78 
 
 		 185 aa  95.5  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  34.92 
 
 		 311 aa  95.5  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  37.14 
 
 		 214 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  30.91 
 
 		 209 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  32.38 
 
 		 313 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  37.85 
 
 		 173 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  28.89 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  28.89 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  28.89 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  33 
 
 		 188 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  33 
 
 		 188 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  33.33 
 
 		 230 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  36.99 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  36.99 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  38.86 
 
 		 184 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  35.63 
 
 		 191 aa  89.4  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  34.02 
 
 		 194 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  34.24 
 
 		 186 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  35.5 
 
 		 192 aa  89  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  31.47 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  35.67 
 
 		 188 aa  89  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32 
 
 		 197 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  33.5 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  38.6 
 
 		 197 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  36 
 
 		 174 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.85 
 
 		 199 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  36.22 
 
 		 206 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  37.77 
 
 		 198 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  32.8 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  35.45 
 
 		 219 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  34.83 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  32.47 
 
 		 194 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  34.21 
 
 		 173 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  31.4 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  27.44 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  32.42 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  32.46 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  34.07 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  32.8 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  32.42 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  34.55 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  34.9 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  31.65 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  36.56 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  33.68 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  35.2 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  28.35 
 
 		 193 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  28.63 
 
 		 231 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0393  signal peptidase I  30.41 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  31.5 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  31.48 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>