More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5920 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  100 
 
 		 299 aa  603  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  54.92 
 
 		 341 aa  318  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  58.1 
 
 		 288 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  48.1 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  45.92 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  42.74 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  42.74 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  42.74 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  45.11 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  40.07 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  38.89 
 
 		 284 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  41.95 
 
 		 291 aa  175  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  40.67 
 
 		 338 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  38.16 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  41.75 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  43.83 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  42.02 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  37.91 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  37.41 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  41.77 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  42.08 
 
 		 352 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  39.9 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  41.18 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  40.89 
 
 		 434 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  39.15 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  35.69 
 
 		 311 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  40.37 
 
 		 268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  42.03 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  37.22 
 
 		 213 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  37.67 
 
 		 213 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  37.78 
 
 		 469 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  33.47 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  38.07 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  35.89 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  37.67 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  35.43 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  35.4 
 
 		 247 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  38.33 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  39.57 
 
 		 219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  34.19 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  38.57 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  35.71 
 
 		 225 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  38.86 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  36.16 
 
 		 230 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  32.92 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  34.18 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  35.86 
 
 		 225 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  37.2 
 
 		 220 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  33.94 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  34.83 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  34.36 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  33.64 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  36.24 
 
 		 184 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  31.56 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  34.93 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  31.34 
 
 		 190 aa  99.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  34.88 
 
 		 199 aa  97.8  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  34.84 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  31.73 
 
 		 190 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  33.33 
 
 		 197 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  31.3 
 
 		 192 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  31.8 
 
 		 209 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  35.16 
 
 		 247 aa  94.7  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  32.69 
 
 		 193 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  34.95 
 
 		 173 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  30.18 
 
 		 214 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  30.63 
 
 		 215 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  35.05 
 
 		 203 aa  89.4  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  31.46 
 
 		 200 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  31.46 
 
 		 200 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  35.16 
 
 		 174 aa  89.4  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  34.78 
 
 		 215 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  35.08 
 
 		 192 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  30.45 
 
 		 220 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  32.86 
 
 		 197 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  28.87 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  30 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  29.6 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  30.66 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  28.43 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  32.86 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  32.54 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  32.11 
 
 		 189 aa  81.6  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  28.99 
 
 		 220 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  30.45 
 
 		 186 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  29.77 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  30.56 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  30.73 
 
 		 176 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  31.61 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  28.63 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  29.65 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  32.31 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  33.16 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  33.17 
 
 		 208 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  30 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  28.57 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  28.57 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  28.91 
 
 		 173 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  28.57 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  29.06 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>