More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1556 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  100 
 
 
311 aa  622  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  48.57 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  47.75 
 
 
291 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  48.69 
 
 
289 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  43.64 
 
 
338 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  49.16 
 
 
269 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  44.13 
 
 
291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  41.13 
 
 
290 aa  192  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  43.78 
 
 
304 aa  182  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  42.98 
 
 
313 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  36.09 
 
 
341 aa  178  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  41.3 
 
 
289 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  44.17 
 
 
209 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  38.73 
 
 
288 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  40.75 
 
 
434 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  42.68 
 
 
213 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  43.82 
 
 
266 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  42.02 
 
 
213 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  38.74 
 
 
272 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  40.41 
 
 
268 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  44.26 
 
 
294 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  39.16 
 
 
469 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  37.75 
 
 
290 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  36.2 
 
 
299 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  40.68 
 
 
247 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  42.38 
 
 
251 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  41.41 
 
 
298 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  38.78 
 
 
304 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  39.63 
 
 
279 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  37.73 
 
 
284 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  40.85 
 
 
352 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  42.86 
 
 
261 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  41.63 
 
 
267 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  38.53 
 
 
286 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  36.33 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  45.03 
 
 
219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  41.35 
 
 
254 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  36.87 
 
 
225 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  35.56 
 
 
267 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  41.1 
 
 
220 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  39.44 
 
 
290 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  37.4 
 
 
284 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  37.4 
 
 
284 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  37.4 
 
 
284 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  39.27 
 
 
225 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  38.86 
 
 
230 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  40.2 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  38.84 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  38.83 
 
 
199 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  35.81 
 
 
250 aa  123  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  36.52 
 
 
220 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  36.28 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  32.79 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  35.5 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  33.18 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  36.09 
 
 
216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  35.16 
 
 
184 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  34.9 
 
 
192 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  37.38 
 
 
221 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  36.36 
 
 
235 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  35.05 
 
 
197 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  34.55 
 
 
200 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  34.55 
 
 
200 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  34.23 
 
 
184 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  34.38 
 
 
220 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  31.11 
 
 
185 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  33.64 
 
 
171 aa  98.2  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  33.17 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  35.58 
 
 
173 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  33.04 
 
 
183 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  29.43 
 
 
288 aa  96.7  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  28.06 
 
 
263 aa  96.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  32.77 
 
 
247 aa  95.9  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  31.58 
 
 
214 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  33.49 
 
 
215 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  32.5 
 
 
174 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  32.89 
 
 
199 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  34.08 
 
 
219 aa  93.2  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  33.33 
 
 
259 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  31.98 
 
 
284 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  31.98 
 
 
284 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  31.15 
 
 
283 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  29.18 
 
 
256 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  31.17 
 
 
284 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  31.58 
 
 
284 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  31.11 
 
 
183 aa  92.4  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  33.33 
 
 
190 aa  92.4  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  30.67 
 
 
183 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  34.15 
 
 
226 aa  92  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  32.79 
 
 
240 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  33.01 
 
 
200 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  33.96 
 
 
188 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  31.4 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  30.83 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  32 
 
 
230 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  28.7 
 
 
216 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  30.65 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  29.86 
 
 
189 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  33.47 
 
 
247 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  30.65 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>