More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0699 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  82.35 
 
 
221 aa  381  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  50.68 
 
 
231 aa  215  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  51.14 
 
 
238 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  48.86 
 
 
230 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  51.17 
 
 
234 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05771  Signal peptidase I  49.25 
 
 
211 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  43.3 
 
 
219 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  45.81 
 
 
219 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  44.05 
 
 
219 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  41.29 
 
 
220 aa  132  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  37.21 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  35.59 
 
 
214 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  36.2 
 
 
192 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  36.21 
 
 
190 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  36.57 
 
 
193 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  36.04 
 
 
198 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  35.78 
 
 
190 aa  119  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  37.56 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  37.56 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  38.33 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  37.14 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  36.82 
 
 
360 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  38.35 
 
 
199 aa  112  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  36.32 
 
 
176 aa  111  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  34.39 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  33.33 
 
 
187 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  33.63 
 
 
194 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9241  predicted protein  36.95 
 
 
178 aa  108  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  32.65 
 
 
173 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  36.67 
 
 
194 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  34.27 
 
 
188 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  34.27 
 
 
188 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  37.32 
 
 
171 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  34.11 
 
 
217 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  35.71 
 
 
194 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  37.5 
 
 
203 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  33.48 
 
 
291 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  35.16 
 
 
173 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  37.44 
 
 
304 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  36.73 
 
 
194 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  34.05 
 
 
215 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  32.02 
 
 
189 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  38.18 
 
 
290 aa  99.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  33.17 
 
 
185 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  36.71 
 
 
311 aa  98.6  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  37.67 
 
 
289 aa  98.6  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  38.38 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  29.69 
 
 
186 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  31.98 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  33.94 
 
 
291 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  34.83 
 
 
196 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  35.32 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  31.98 
 
 
213 aa  95.9  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  30.59 
 
 
185 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  33.63 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  31.15 
 
 
338 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  33.49 
 
 
225 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  31.62 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  35.38 
 
 
349 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  32.86 
 
 
174 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  35.38 
 
 
349 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  32.91 
 
 
216 aa  92.8  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  34.52 
 
 
225 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  34.5 
 
 
206 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  37.19 
 
 
267 aa  91.7  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  32.2 
 
 
279 aa  91.7  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  33.83 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  30.61 
 
 
193 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  29.51 
 
 
286 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  31.5 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  32.05 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0578  signal peptidase I  31.77 
 
 
176 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  32.79 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  33.17 
 
 
198 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0564  signal peptidase I  32.24 
 
 
176 aa  88.2  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  31.76 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0432  signal peptidase I  34.85 
 
 
180 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0849039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  32.92 
 
 
304 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  34.54 
 
 
196 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  34.47 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  34.89 
 
 
262 aa  87  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0427  Signal peptidase I  35.35 
 
 
180 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  33.04 
 
 
341 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  32.65 
 
 
289 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  31.11 
 
 
284 aa  86.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  30.59 
 
 
184 aa  87  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  31.48 
 
 
322 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  32.37 
 
 
288 aa  86.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  31.48 
 
 
322 aa  86.3  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  32.57 
 
 
469 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  29.46 
 
 
297 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  31.08 
 
 
199 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  29.46 
 
 
297 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  28.9 
 
 
272 aa  85.5  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  34.78 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  28.33 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  35.62 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  30.53 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  33.66 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>