More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4169 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  100 
 
 
284 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  83.97 
 
 
286 aa  484  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  80.39 
 
 
284 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  80.39 
 
 
284 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  80.39 
 
 
284 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  72.76 
 
 
294 aa  384  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  49.6 
 
 
309 aa  228  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  48.85 
 
 
288 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  45.71 
 
 
341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  50 
 
 
288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  46.69 
 
 
313 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  46.15 
 
 
272 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  38.71 
 
 
299 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  37.94 
 
 
338 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  41.3 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  38.53 
 
 
311 aa  135  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  34.64 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  37.21 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  33.69 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  35.15 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  39.63 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  34.75 
 
 
469 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  36.06 
 
 
360 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  35.15 
 
 
213 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  34.16 
 
 
352 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  34.22 
 
 
304 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  35.69 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  34.18 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  34.6 
 
 
209 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  32.05 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  36.95 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  35.81 
 
 
230 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  34.63 
 
 
342 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  34.71 
 
 
434 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  35.71 
 
 
174 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  34.63 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  36.55 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  30.04 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  35.89 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  37.56 
 
 
250 aa  114  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  32.53 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  34.69 
 
 
266 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  33.19 
 
 
185 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  34.94 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  38.26 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  32.67 
 
 
192 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  33.05 
 
 
197 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  34.26 
 
 
254 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  37.26 
 
 
203 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  38.28 
 
 
251 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  34.42 
 
 
267 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  36.17 
 
 
209 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  35.81 
 
 
190 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  35.12 
 
 
247 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  34.57 
 
 
188 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  33.47 
 
 
184 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  33.78 
 
 
193 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  34.78 
 
 
220 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  32.47 
 
 
183 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  32.9 
 
 
183 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  33.62 
 
 
197 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  32.62 
 
 
189 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  32.9 
 
 
183 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  34.43 
 
 
225 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  32.76 
 
 
186 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  35.92 
 
 
184 aa  98.2  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  31.74 
 
 
198 aa  95.5  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  32.03 
 
 
183 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  32.03 
 
 
183 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  32.03 
 
 
183 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  32.03 
 
 
183 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  32.03 
 
 
183 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  32.03 
 
 
183 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  32.14 
 
 
173 aa  94  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  29.15 
 
 
173 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  28.36 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  32.39 
 
 
219 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  32.03 
 
 
216 aa  92.8  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  34 
 
 
188 aa  92.8  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  31.6 
 
 
183 aa  92  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  31.6 
 
 
183 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  31.6 
 
 
183 aa  92  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  31.88 
 
 
191 aa  90.9  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  34.76 
 
 
192 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  35.75 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  29.78 
 
 
200 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  29.78 
 
 
200 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  33.18 
 
 
243 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  30.26 
 
 
215 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  29.03 
 
 
215 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  27.83 
 
 
186 aa  89  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  29.31 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  30.8 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  28.57 
 
 
189 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  31.4 
 
 
199 aa  87.4  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  29.87 
 
 
231 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  28 
 
 
234 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  29.79 
 
 
220 aa  86.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  27.83 
 
 
192 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  33.97 
 
 
225 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>