More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3131 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  50 
 
 		 313 aa  238  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  48.26 
 
 		 341 aa  234  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  49.79 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  47.9 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  46.52 
 
 		 284 aa  204  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  46.47 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  45.68 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  45.68 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  45.68 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  47.35 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  41.88 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  41.28 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  44.18 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  41.3 
 
 		 250 aa  175  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  40.96 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  41.57 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  39.77 
 
 		 360 aa  168  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  40.54 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  43.46 
 
 		 309 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  40.3 
 
 		 352 aa  165  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  43.78 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  40.51 
 
 		 434 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  44.17 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  40.08 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  40.73 
 
 		 289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  36.71 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  36.55 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  37.94 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  37.06 
 
 		 469 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  39.24 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  36.05 
 
 		 230 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  33.95 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  35.96 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  36.18 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  34.07 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  32.94 
 
 		 209 aa  118  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  33.33 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  34.96 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  34.33 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  34.58 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  35.51 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  33.71 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  34.1 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  35.51 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  35.66 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  36.23 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  37.21 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  34.88 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  34.36 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  34.36 
 
 		 193 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  35.92 
 
 		 342 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  35.16 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  31 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  35.32 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  34.32 
 
 		 208 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  31.73 
 
 		 200 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  31.73 
 
 		 200 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  35.34 
 
 		 215 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  33.05 
 
 		 214 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  34.05 
 
 		 190 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  33.33 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  30.43 
 
 		 187 aa  95.5  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  31.39 
 
 		 209 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  29.03 
 
 		 197 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  32.1 
 
 		 184 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  33.78 
 
 		 189 aa  92.8  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  33.82 
 
 		 188 aa  92.4  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  32.08 
 
 		 203 aa  92  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  31.76 
 
 		 174 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  29.67 
 
 		 185 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  31.98 
 
 		 198 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  31.47 
 
 		 173 aa  90.1  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  30.93 
 
 		 216 aa  89.7  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  29.18 
 
 		 217 aa  89.7  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  30 
 
 		 215 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  30.34 
 
 		 181 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  33.82 
 
 		 184 aa  86.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  32.7 
 
 		 191 aa  86.3  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  29.6 
 
 		 197 aa  85.9  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  28.9 
 
 		 235 aa  85.9  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  28.19 
 
 		 173 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  29.36 
 
 		 189 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  29.69 
 
 		 216 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  32.64 
 
 		 199 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  28.1 
 
 		 193 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  31.9 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  31.65 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  31.55 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  30.6 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  27.15 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  31.34 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  31.09 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  27.71 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  31.12 
 
 		 220 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  26.69 
 
 		 234 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  28.77 
 
 		 199 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  31.22 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  30 
 
 		 173 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  30.3 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>