More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2079 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2462  signal peptidase I  55.85 
 
 		 189 aa  239  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0073  signal peptidase I  43.32 
 
 		 183 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2135  signal peptidase I  38.83 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0591499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  38.86 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  36.13 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  36.32 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  35.79 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  35.79 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  35.79 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  35.79 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  35.79 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  35.79 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  35.94 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  35.79 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  33.68 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  35.83 
 
 		 190 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  37.37 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  37.77 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  36.6 
 
 		 236 aa  99.8  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  33.51 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  34.74 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  38.02 
 
 		 291 aa  98.2  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  35.64 
 
 		 248 aa  98.2  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  38.29 
 
 		 209 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  33.85 
 
 		 183 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  33.85 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  34.25 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  33.85 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  33.85 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  33.85 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  33.85 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  33.85 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  32.63 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  32.63 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  35.43 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  33.9 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  32.29 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  36.52 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  36 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  36 
 
 		 193 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  33.85 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  32.98 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  33.85 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  36.98 
 
 		 290 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  33.86 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  32.04 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  35.78 
 
 		 262 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  34.83 
 
 		 173 aa  92.8  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  31.25 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  34.39 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  34.3 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  37.65 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  33.71 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  33.71 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  36.22 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  32.5 
 
 		 243 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  33.15 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  34.09 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  36.56 
 
 		 338 aa  89.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  32.43 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  35.79 
 
 		 304 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  34.38 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  32.29 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  32.29 
 
 		 233 aa  87.8  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  32.5 
 
 		 243 aa  88.2  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  32.64 
 
 		 220 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  32.61 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  32.61 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  37.34 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  34.74 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  29.76 
 
 		 215 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  35.06 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  30.2 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  34.18 
 
 		 313 aa  85.9  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  31.94 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  30.2 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  33.86 
 
 		 289 aa  85.5  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  30.86 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  30.21 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  29.69 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  37.91 
 
 		 289 aa  85.1  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  29.69 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  29.69 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  33.52 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  29.69 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  32.09 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  35.4 
 
 		 170 aa  84.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  29.69 
 
 		 187 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  31.15 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  32.46 
 
 		 214 aa  84.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  35.36 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  33.51 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  33.87 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  32.12 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  32.37 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  36.72 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  30.48 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1861  Signal peptidase I  29.95 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0958721  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  31.34 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>