More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0764 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  100 
 
 
221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  43.3 
 
 
233 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0073  signal peptidase I  37.02 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  36.73 
 
 
183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  41.54 
 
 
185 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  36.36 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  36.98 
 
 
184 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  34.9 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  34.9 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  34.9 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  34.9 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  34.9 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  34.9 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  35.42 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  34.38 
 
 
183 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  40.12 
 
 
173 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  38.42 
 
 
176 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  34.9 
 
 
183 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  35.9 
 
 
183 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  33.85 
 
 
183 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  33.85 
 
 
183 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  34.25 
 
 
268 aa  105  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  37.06 
 
 
190 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  34.38 
 
 
173 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  35.6 
 
 
174 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  36.09 
 
 
197 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  35.68 
 
 
199 aa  102  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  37.37 
 
 
188 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2462  signal peptidase I  35.11 
 
 
189 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  35.1 
 
 
192 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  34.9 
 
 
174 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  34.87 
 
 
183 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  34.87 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  34.87 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  34.87 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  34.87 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  34.87 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  34.87 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  34.87 
 
 
183 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  35.08 
 
 
183 aa  99  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  34.47 
 
 
271 aa  99  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  34.46 
 
 
171 aa  98.6  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2135  signal peptidase I  34.55 
 
 
194 aa  98.6  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0591499  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0206  signal peptidase I  37.57 
 
 
182 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678677  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  34.16 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  33.51 
 
 
188 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  30.85 
 
 
191 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  30.85 
 
 
191 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  35.79 
 
 
186 aa  95.5  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  34.46 
 
 
189 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  35.45 
 
 
182 aa  95.1  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  37.37 
 
 
172 aa  95.1  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  32.82 
 
 
186 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  34.72 
 
 
198 aa  94.7  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  33.16 
 
 
198 aa  94.7  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  31.94 
 
 
173 aa  94  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  30 
 
 
187 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  36.46 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  31.03 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  27.07 
 
 
279 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  30.7 
 
 
216 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2156  signal peptidase I  35.26 
 
 
173 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3112  Signal peptidase I  38.07 
 
 
173 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3092  signal peptidase I  38.07 
 
 
173 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2871  Signal peptidase I  38.07 
 
 
173 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2841  signal peptidase I  38.07 
 
 
173 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000384139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2801  signal peptidase I  36.41 
 
 
173 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3086  Signal peptidase I  38.07 
 
 
173 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  34.83 
 
 
220 aa  92.8  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  30.5 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  35.45 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  34.97 
 
 
189 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  31.09 
 
 
187 aa  92.8  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  31.3 
 
 
291 aa  92.4  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3111  signal peptidase I  35.87 
 
 
173 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.349413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  34.95 
 
 
184 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  35.36 
 
 
192 aa  91.7  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  32.8 
 
 
214 aa  91.7  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  31.66 
 
 
200 aa  91.3  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  30.87 
 
 
304 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  31.09 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  31.09 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  30.93 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  31.09 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  33.33 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3079  signal peptidase I  35.79 
 
 
173 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  31.61 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  34.43 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  32.46 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  30.61 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  36.96 
 
 
173 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  30.61 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  31.09 
 
 
187 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  30.61 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  37.42 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  26.61 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  32.46 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  32.37 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  31.6 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  33.67 
 
 
181 aa  89.4  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>