More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2878 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  43.15 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  41.1 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  40.41 
 
 		 183 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  39.77 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  37.31 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  40.74 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  37.31 
 
 		 183 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  37.31 
 
 		 183 aa  121  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  37.31 
 
 		 183 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  37.31 
 
 		 183 aa  121  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  37.31 
 
 		 183 aa  121  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  37.31 
 
 		 183 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  37.31 
 
 		 183 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  36.79 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  36.79 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  40.46 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  40.46 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  36.27 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  31.53 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  41.56 
 
 		 172 aa  114  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  34.8 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  32.89 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  40.98 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  37.57 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  37.28 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  41.32 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  35.48 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  40.61 
 
 		 183 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  37.28 
 
 		 186 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  40.61 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  40.61 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  40.61 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  40.61 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  40.61 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  40.61 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  35.23 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  34.39 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  35.9 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  32.16 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  39.39 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  39.63 
 
 		 183 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  33.96 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  32.39 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  34.36 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  32.79 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  35.96 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  32.79 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  34.13 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  35.47 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  35.47 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  35.39 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  31.18 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  35.96 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  35.8 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  36.84 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  30.81 
 
 		 190 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  34.73 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  33 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  39.26 
 
 		 174 aa  101  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  28.92 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  32.96 
 
 		 188 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  30.27 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  33.68 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  30.73 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  38.79 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  34.9 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  33.51 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  30.81 
 
 		 248 aa  98.6  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  30.81 
 
 		 248 aa  98.6  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  42.36 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  34.44 
 
 		 189 aa  98.2  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  34.44 
 
 		 171 aa  97.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0024  signal peptidase I  34.55 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2801  signal peptidase I  31.14 
 
 		 173 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2503  signal peptidase I  36.49 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127796  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  33.67 
 
 		 221 aa  95.5  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  32.08 
 
 		 313 aa  95.5  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  33.65 
 
 		 233 aa  95.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  32.79 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  32.61 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  33.5 
 
 		 284 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  33.15 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  40.44 
 
 		 178 aa  95.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  32.97 
 
 		 173 aa  95.1  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  34.1 
 
 		 182 aa  95.1  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  32.24 
 
 		 187 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2871  Signal peptidase I  30.54 
 
 		 173 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3092  signal peptidase I  30.54 
 
 		 173 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2841  signal peptidase I  30.54 
 
 		 173 aa  94.7  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000384139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  32.24 
 
 		 187 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3086  Signal peptidase I  30.54 
 
 		 173 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  36.54 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  32.24 
 
 		 187 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3112  Signal peptidase I  30.54 
 
 		 173 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3111  signal peptidase I  29.94 
 
 		 173 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.349413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  32.61 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  29.95 
 
 		 267 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  31.53 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  32.61 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>