More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1804 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  100 
 
 
178 aa  353  5.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1523  signal peptidase I  94.94 
 
 
178 aa  304  6e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000512014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  39.24 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  43.05 
 
 
173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  38.61 
 
 
190 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  40.51 
 
 
198 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  35.15 
 
 
214 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  37.74 
 
 
220 aa  104  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0388  signal peptidase I  42.68 
 
 
178 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.932746  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  38.78 
 
 
189 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  37.95 
 
 
200 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0529  signal peptidase I S  42.21 
 
 
177 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  37.95 
 
 
200 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0528  signal peptidase I S  41.42 
 
 
178 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  38.78 
 
 
186 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  39.29 
 
 
183 aa  101  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  39.88 
 
 
183 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  39.88 
 
 
183 aa  101  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  36.16 
 
 
209 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  40.14 
 
 
192 aa  100  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  36.69 
 
 
183 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  35.98 
 
 
199 aa  100  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  38.15 
 
 
186 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0392  signal peptidase I (SPase I)  40.83 
 
 
178 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  36.31 
 
 
173 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  38.96 
 
 
173 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  37.27 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  36.69 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  36.69 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  36.69 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  36.69 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  36.69 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  36.69 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  38.04 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0459  signal peptidase I S  42.04 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  40 
 
 
188 aa  99.4  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  42.51 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  36.09 
 
 
183 aa  99  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0393  signal peptidase I  41.61 
 
 
177 aa  98.6  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  41.72 
 
 
193 aa  98.2  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  38.69 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  36.09 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  38.69 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  38.69 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  38.69 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  38.69 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  38.69 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  38.69 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  39.52 
 
 
187 aa  98.2  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  38.69 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  36.31 
 
 
183 aa  97.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4845  signal peptidase I  42.68 
 
 
177 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  40.12 
 
 
187 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  37.58 
 
 
189 aa  97.8  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  37.34 
 
 
201 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  40.12 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  40.12 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  40.12 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  38.46 
 
 
192 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  35.03 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  40.12 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  40.72 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  40.12 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  39.49 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  32.97 
 
 
215 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  40.12 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  40.12 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  34.04 
 
 
221 aa  96.3  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  33.75 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  36.63 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  35.8 
 
 
174 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  36.59 
 
 
192 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  36.2 
 
 
193 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  33.33 
 
 
200 aa  93.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  38.46 
 
 
170 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  30.43 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0478  signal peptidase I  40.76 
 
 
177 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  34.15 
 
 
197 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0206  signal peptidase I  36.14 
 
 
182 aa  92  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2156  signal peptidase I  38.31 
 
 
173 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  33.14 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  32.37 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  33.78 
 
 
197 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2462  signal peptidase I  38.29 
 
 
189 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  33.52 
 
 
189 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  33.33 
 
 
222 aa  88.6  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  38.36 
 
 
193 aa  89  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  32.85 
 
 
179 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0073  signal peptidase I  35.43 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  32.04 
 
 
219 aa  88.6  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  36.36 
 
 
225 aa  88.2  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.72 
 
 
198 aa  88.2  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  35.44 
 
 
214 aa  88.2  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  33.86 
 
 
187 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  35.8 
 
 
225 aa  87.8  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0400  signal peptidase I  38.36 
 
 
176 aa  87  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  31.76 
 
 
220 aa  87  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  40.13 
 
 
185 aa  87  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  34.39 
 
 
185 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  31.79 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>