More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11010 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  100 
 
 
189 aa  383  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  61.88 
 
 
191 aa  225  3e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  56.02 
 
 
188 aa  213  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  50.52 
 
 
188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  52.63 
 
 
184 aa  158  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  37.67 
 
 
313 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  38.27 
 
 
189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  37.43 
 
 
197 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  38.61 
 
 
174 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  33.79 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  35.93 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  38.37 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  31.43 
 
 
193 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  36.36 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  31.64 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  36.77 
 
 
288 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  31.67 
 
 
185 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34.95 
 
 
199 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  34.43 
 
 
268 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  34.94 
 
 
173 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  37.65 
 
 
171 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  37.57 
 
 
197 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  37.28 
 
 
200 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  33.33 
 
 
192 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  37.28 
 
 
200 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  34.57 
 
 
173 aa  104  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  39.87 
 
 
220 aa  104  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  37.8 
 
 
214 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34.3 
 
 
200 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  37.74 
 
 
203 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.07 
 
 
198 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  35.93 
 
 
190 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  35.84 
 
 
220 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  36.69 
 
 
221 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  37.5 
 
 
216 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  33 
 
 
236 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  34.08 
 
 
190 aa  101  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  31.66 
 
 
233 aa  101  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  36.48 
 
 
222 aa  101  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  35.44 
 
 
338 aa  101  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  33.53 
 
 
181 aa  101  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  32.62 
 
 
284 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  33.12 
 
 
186 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  36.09 
 
 
225 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  38.18 
 
 
193 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.86 
 
 
225 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  37.5 
 
 
170 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  38.18 
 
 
192 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  37.35 
 
 
221 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  34.76 
 
 
219 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  34.44 
 
 
216 aa  99  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  34.29 
 
 
262 aa  99  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  35.24 
 
 
341 aa  99  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  34.55 
 
 
216 aa  99  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  31.96 
 
 
284 aa  98.6  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  32.86 
 
 
215 aa  98.6  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  34.44 
 
 
201 aa  98.2  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  34.31 
 
 
291 aa  97.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  31.84 
 
 
176 aa  97.8  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  28.8 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  31.46 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  31.46 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  31.46 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  31.46 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  31.46 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  31.46 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  30.34 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  35.11 
 
 
434 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  31.46 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  34.27 
 
 
215 aa  95.9  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  37.43 
 
 
230 aa  95.9  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  31.35 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  33.82 
 
 
360 aa  95.9  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  34.62 
 
 
213 aa  95.5  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  33.48 
 
 
294 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  31.28 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  37.11 
 
 
226 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  32.5 
 
 
243 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  35.54 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  34.83 
 
 
209 aa  95.5  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  34.46 
 
 
190 aa  95.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  30.9 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  35.67 
 
 
214 aa  95.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  35.84 
 
 
219 aa  95.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  30.9 
 
 
183 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  32 
 
 
243 aa  94.4  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  30.67 
 
 
284 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  30.67 
 
 
284 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  34.78 
 
 
213 aa  93.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  30.67 
 
 
284 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  31.61 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  31.61 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  31.61 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  31.61 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  31.61 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  34.26 
 
 
272 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  31.61 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  31.61 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  30.64 
 
 
198 aa  93.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  33.86 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>