More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3289 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  100 
 
 
173 aa  349  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  50.6 
 
 
220 aa  182  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  48.5 
 
 
214 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  50 
 
 
189 aa  178  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  47.31 
 
 
200 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  47.31 
 
 
200 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  47.88 
 
 
209 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  44.51 
 
 
192 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  44.51 
 
 
193 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  44.85 
 
 
198 aa  157  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  42.68 
 
 
197 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  44.67 
 
 
203 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  42.29 
 
 
181 aa  153  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  39.63 
 
 
190 aa  148  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  40.85 
 
 
190 aa  147  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  43.64 
 
 
220 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  40.46 
 
 
176 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  45.14 
 
 
185 aa  144  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  39.41 
 
 
197 aa  143  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  42.01 
 
 
188 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  41.42 
 
 
188 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  39.56 
 
 
217 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  44.52 
 
 
196 aa  142  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  42.31 
 
 
187 aa  142  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  44.87 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  37.5 
 
 
216 aa  138  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  41.57 
 
 
193 aa  137  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  42.77 
 
 
173 aa  137  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  39.89 
 
 
215 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  42.14 
 
 
196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  39.89 
 
 
217 aa  133  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  40.33 
 
 
194 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  37.63 
 
 
199 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  41.04 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  38.92 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  40.24 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  43.4 
 
 
194 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  38.46 
 
 
194 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  37.91 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  36.79 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  38.15 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  38.51 
 
 
173 aa  124  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  34.48 
 
 
199 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  37.02 
 
 
183 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9241  predicted protein  35.54 
 
 
178 aa  120  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  38.67 
 
 
183 aa  121  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  44.83 
 
 
349 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  44.83 
 
 
349 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  38.67 
 
 
183 aa  120  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  38.67 
 
 
183 aa  120  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  38.67 
 
 
183 aa  120  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  38.67 
 
 
183 aa  120  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  38.67 
 
 
183 aa  120  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  38.67 
 
 
183 aa  120  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  38.67 
 
 
183 aa  120  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  38.42 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  39.78 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  39.41 
 
 
192 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  38.12 
 
 
183 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  36.25 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  38.36 
 
 
206 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  41.32 
 
 
192 aa  117  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  38.8 
 
 
373 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0427  Signal peptidase I  40.62 
 
 
180 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  38.55 
 
 
219 aa  117  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  34.97 
 
 
221 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  34.55 
 
 
216 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  38.8 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0432  signal peptidase I  40 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0849039  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  34.62 
 
 
191 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  40.96 
 
 
189 aa  114  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  34.62 
 
 
191 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  37.02 
 
 
188 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  34.44 
 
 
216 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  41.04 
 
 
184 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  40.96 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  36.36 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  37.36 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  37.36 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  37.36 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  32.98 
 
 
234 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  35.96 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  37.36 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  38.67 
 
 
183 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  37.91 
 
 
187 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  38.67 
 
 
183 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  37.36 
 
 
187 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  37.34 
 
 
184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  38.67 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  38.67 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  38.67 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  38.67 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  38.67 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  38.67 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  32.45 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  38.67 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  36.81 
 
 
187 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  36.81 
 
 
187 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  36.81 
 
 
187 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  34.29 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>