More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1833 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  100 
 
 
220 aa  447  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  58.29 
 
 
209 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  50.43 
 
 
289 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  48.71 
 
 
291 aa  191  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  53.3 
 
 
269 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  42.32 
 
 
360 aa  175  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  52.08 
 
 
213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  52.08 
 
 
213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  45.29 
 
 
338 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  45.02 
 
 
291 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  45.79 
 
 
313 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  40.97 
 
 
268 aa  145  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  40.38 
 
 
469 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  47.78 
 
 
261 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  44.44 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  43.27 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  47.19 
 
 
230 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  40.28 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  46.02 
 
 
199 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  38.5 
 
 
304 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  38.53 
 
 
284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  38.94 
 
 
290 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  41.1 
 
 
311 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  39.09 
 
 
290 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  42.51 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  36.82 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  40.78 
 
 
304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  41.63 
 
 
434 aa  127  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  41.59 
 
 
352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  41.55 
 
 
251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  42.25 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  44.2 
 
 
254 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  38.38 
 
 
216 aa  121  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  36.49 
 
 
266 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  40.22 
 
 
285 aa  119  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  43.29 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  38.25 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  38.18 
 
 
289 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  37.19 
 
 
294 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  34.8 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  44.91 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  37.07 
 
 
288 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  39.67 
 
 
262 aa  115  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  36.82 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  35.66 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  37.13 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  36 
 
 
341 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  34.48 
 
 
272 aa  111  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  44.58 
 
 
174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  37.39 
 
 
299 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  35.37 
 
 
284 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  35.68 
 
 
185 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  38.3 
 
 
247 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  33.8 
 
 
284 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  33.8 
 
 
284 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  33.8 
 
 
284 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  38.67 
 
 
188 aa  98.2  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  40.22 
 
 
171 aa  98.2  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  33.82 
 
 
190 aa  98.2  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  34.7 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  36.7 
 
 
183 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  38.76 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  35.64 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  41.11 
 
 
197 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  36.22 
 
 
183 aa  94.7  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  35.11 
 
 
183 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  35.11 
 
 
183 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  35.11 
 
 
183 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  35.11 
 
 
183 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  35.11 
 
 
183 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  35.11 
 
 
183 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  35.11 
 
 
183 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  37.36 
 
 
209 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  34.62 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  35.56 
 
 
309 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  34.18 
 
 
201 aa  92.4  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  37.5 
 
 
181 aa  92  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  38.12 
 
 
188 aa  91.7  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  37.01 
 
 
172 aa  91.3  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  34.83 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  31.82 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  35.56 
 
 
192 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  35.11 
 
 
200 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  36.46 
 
 
190 aa  89  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  37.78 
 
 
189 aa  89  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  34.04 
 
 
183 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  34.04 
 
 
183 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  35.56 
 
 
193 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  35.38 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  31.39 
 
 
271 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.32 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  34 
 
 
288 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  33.5 
 
 
219 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  33.72 
 
 
183 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  34.76 
 
 
199 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  31.34 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  32.95 
 
 
187 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  31.34 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  35.86 
 
 
221 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  30.77 
 
 
193 aa  85.5  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>