More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10030 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  100 
 
 
192 aa  376  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  43.69 
 
 
225 aa  154  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  43.58 
 
 
219 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  46.07 
 
 
225 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  40.7 
 
 
279 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  38.46 
 
 
291 aa  138  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  40.47 
 
 
284 aa  134  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  39.07 
 
 
290 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  40.82 
 
 
267 aa  127  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  43.02 
 
 
220 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  36.5 
 
 
360 aa  124  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  42.94 
 
 
247 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  39.25 
 
 
289 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  37.31 
 
 
268 aa  123  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  39.78 
 
 
269 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  37.91 
 
 
247 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  35.32 
 
 
291 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  36.79 
 
 
338 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  40.91 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  36.76 
 
 
313 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  40.59 
 
 
209 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  39.66 
 
 
251 aa  111  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  36.1 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  38.67 
 
 
254 aa  110  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  34.6 
 
 
469 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  36.1 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  37.44 
 
 
216 aa  108  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  39.89 
 
 
243 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  35.87 
 
 
311 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  35.88 
 
 
185 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  32.68 
 
 
266 aa  101  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  33.16 
 
 
304 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  35.8 
 
 
174 aa  99.4  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  34.62 
 
 
290 aa  98.6  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  32.92 
 
 
284 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  30.8 
 
 
304 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  35.71 
 
 
183 aa  97.8  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  31.07 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  33.77 
 
 
286 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  31.1 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.76 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  37.5 
 
 
294 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  30.62 
 
 
230 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  32.28 
 
 
290 aa  95.1  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  32.11 
 
 
288 aa  94.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  32.6 
 
 
181 aa  94  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  38.51 
 
 
173 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  35.78 
 
 
341 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  33.14 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  34.98 
 
 
299 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  31.73 
 
 
289 aa  92  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  37.08 
 
 
261 aa  91.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  37.93 
 
 
230 aa  91.3  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  35.26 
 
 
285 aa  91.3  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  36.63 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  30.97 
 
 
272 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  33.14 
 
 
262 aa  87  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  31.79 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  42.58 
 
 
176 aa  87  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  28.65 
 
 
192 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  34.08 
 
 
298 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  33.76 
 
 
373 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  31.87 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  32.91 
 
 
349 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  32.91 
 
 
349 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  32.47 
 
 
284 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  32.47 
 
 
284 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  32.47 
 
 
284 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  30.46 
 
 
190 aa  85.1  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  32.39 
 
 
169 aa  85.1  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  29.55 
 
 
193 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  33 
 
 
182 aa  84.3  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  34.52 
 
 
352 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  32.75 
 
 
256 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  32.26 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  31.09 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  36.88 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  28.63 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  28.12 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  28.37 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  36.09 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  28.28 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  29.02 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  31.15 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  29.02 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  32 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  28.51 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  34.22 
 
 
434 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  29.31 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  31.28 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  27.35 
 
 
252 aa  82  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  35.2 
 
 
171 aa  82  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  31.11 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  31.9 
 
 
255 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  27.98 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  29.14 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  29.02 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  28.9 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  30.81 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  29.44 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>