More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_05711 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  100 
 
 
230 aa  473  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  93.04 
 
 
231 aa  447  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  59.21 
 
 
238 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  53.99 
 
 
234 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05771  Signal peptidase I  58.88 
 
 
211 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  56.19 
 
 
219 aa  232  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  54.93 
 
 
219 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  53.99 
 
 
219 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  48.86 
 
 
235 aa  211  9e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  47.49 
 
 
221 aa  207  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  40.69 
 
 
220 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  40 
 
 
220 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  37.75 
 
 
200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  37.75 
 
 
200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  38.89 
 
 
214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  32.79 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  36.2 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  37.56 
 
 
193 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  36.49 
 
 
197 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  37.81 
 
 
190 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  34.93 
 
 
190 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  34.8 
 
 
209 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  37.75 
 
 
198 aa  121  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  33.06 
 
 
215 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  36.63 
 
 
199 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  35.75 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  37.11 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  31.74 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  34.36 
 
 
189 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  32.39 
 
 
217 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  33.94 
 
 
187 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  32.77 
 
 
360 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  35.03 
 
 
284 aa  106  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  34.55 
 
 
173 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  36.32 
 
 
185 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  33.76 
 
 
291 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  33.01 
 
 
279 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  37.2 
 
 
215 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  31.49 
 
 
213 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  33.96 
 
 
217 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  30.77 
 
 
173 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  30.7 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  30.21 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  36.13 
 
 
304 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  31.86 
 
 
176 aa  96.3  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  32.08 
 
 
186 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  30.34 
 
 
290 aa  95.9  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  34.02 
 
 
196 aa  96.3  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  37.69 
 
 
196 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  34.87 
 
 
197 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  31.78 
 
 
171 aa  95.5  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  32.86 
 
 
290 aa  95.5  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  35.24 
 
 
216 aa  95.1  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  31.75 
 
 
174 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  31.28 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  33.66 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  30.46 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  30.88 
 
 
294 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  31.12 
 
 
341 aa  92  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  30.33 
 
 
188 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  32.82 
 
 
267 aa  91.7  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  29.29 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  30.33 
 
 
188 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  33.02 
 
 
469 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  27.97 
 
 
286 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  34.69 
 
 
434 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  32.65 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  34.69 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  30.85 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  32.44 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  31.9 
 
 
289 aa  90.1  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  31.56 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  29.44 
 
 
188 aa  90.1  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  33.66 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  29.59 
 
 
184 aa  90.1  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  30.15 
 
 
251 aa  89.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  32.71 
 
 
220 aa  89  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  32.52 
 
 
208 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  29.19 
 
 
181 aa  89  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9241  predicted protein  32.16 
 
 
178 aa  89  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  33.16 
 
 
289 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  33.67 
 
 
352 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  29.31 
 
 
284 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  29.72 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  32.5 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  34.72 
 
 
311 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  31.22 
 
 
185 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  31.22 
 
 
183 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.36 
 
 
198 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  32.46 
 
 
219 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  31.61 
 
 
254 aa  85.9  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  31.13 
 
 
288 aa  85.5  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  31.31 
 
 
261 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  31.63 
 
 
194 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  30 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  25.96 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  25.96 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  29.95 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  29.05 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  25.96 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>