More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0564 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0564  signal peptidase I  100 
 
 		 176 aa  357  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0578  signal peptidase I  98.3 
 
 		 176 aa  353  5e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  56.17 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0432  signal peptidase I  46.24 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0849039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0427  Signal peptidase I  45.66 
 
 		 180 aa  141  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  42.26 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  43.6 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  40.78 
 
 		 214 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  41.04 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  38.1 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  41.71 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  40.24 
 
 		 200 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  38.8 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  40.24 
 
 		 200 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  37.29 
 
 		 220 aa  111  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  38.55 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  39.89 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  39.55 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  35.98 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  34.25 
 
 		 192 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  31.94 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  35.98 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  35.93 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  32.41 
 
 		 221 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  34.16 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  36.52 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  37.74 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  37.21 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  33.33 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  41.78 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  35.2 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  36.48 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  32.39 
 
 		 219 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  37.28 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  34.94 
 
 		 197 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  32.32 
 
 		 200 aa  98.6  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  36.93 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  30.66 
 
 		 219 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  36.78 
 
 		 189 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  34.3 
 
 		 199 aa  94.7  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  30.81 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  30.37 
 
 		 235 aa  94  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  36.84 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  36.22 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  35.68 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  35.68 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  29.84 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  38.79 
 
 		 192 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  29.72 
 
 		 219 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  33.17 
 
 		 304 aa  92  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0024  signal peptidase I  34.43 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  35.14 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  35.14 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  36.59 
 
 		 197 aa  91.3  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  36.41 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  36.41 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  35.14 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  36.41 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  35.14 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  36.41 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  35.14 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  36.41 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  35.14 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  37.08 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  36.41 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  35.14 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  30.11 
 
 		 184 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  32.57 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  33.89 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  35.14 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  38.55 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  35.48 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  33.89 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  36.41 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  34.21 
 
 		 219 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  31.72 
 
 		 283 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  35.14 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  34.29 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  33.71 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  35.87 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  33.71 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  30.06 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  33.71 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  37.22 
 
 		 262 aa  89.4  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  35.87 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  33.71 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  30.16 
 
 		 284 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  29.95 
 
 		 284 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  28.88 
 
 		 284 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  29.9 
 
 		 207 aa  88.2  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  39.13 
 
 		 214 aa  87.8  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  32.75 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  32.75 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  32.75 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  34.78 
 
 		 183 aa  87.4  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  33.92 
 
 		 187 aa  87.4  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  33.86 
 
 		 268 aa  87  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  40.69 
 
 		 349 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  40.69 
 
 		 349 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  36.69 
 
 		 271 aa  86.3  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>