More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3441 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3441  signal peptidase I  100 
 
 		 149 aa  302  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101353  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1836  signal peptidase I  46.77 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  39.55 
 
 		 169 aa  98.6  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  39.44 
 
 		 185 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  40.32 
 
 		 193 aa  90.1  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  37.14 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2156  signal peptidase I  29.86 
 
 		 173 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3079  signal peptidase I  29.17 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0432  signal peptidase I  32.28 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0849039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0564  signal peptidase I  33.81 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  36.17 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0578  signal peptidase I  33.81 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0427  Signal peptidase I  31.06 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  39.86 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3112  Signal peptidase I  28.47 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2871  Signal peptidase I  28.47 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2841  signal peptidase I  28.47 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000384139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3092  signal peptidase I  28.47 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3086  Signal peptidase I  28.47 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  39.13 
 
 		 179 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  27.78 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3111  signal peptidase I  27.78 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.349413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2801  signal peptidase I  28.47 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  36.36 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  33.8 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  38.26 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  30.6 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  39.01 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  34.04 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  30.72 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  30.72 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  30.72 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  30.72 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  30.72 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  33.33 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  30.72 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  30.72 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  32.62 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  35.97 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  34.97 
 
 		 373 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  40.71 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  30.72 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  30.72 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  35.77 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  32.86 
 
 		 349 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  32.86 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  33.09 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  33.33 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  40.98 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  33.81 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  29.94 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  34.53 
 
 		 200 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  34.53 
 
 		 200 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  31.34 
 
 		 214 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  35.25 
 
 		 209 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  37.04 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  32.61 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  32.32 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  33.81 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  30.57 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  33.33 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.87 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  35.82 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  34.11 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  36.3 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  33.1 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  30.53 
 
 		 221 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  29.14 
 
 		 191 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  29.14 
 
 		 191 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  33.77 
 
 		 215 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  30.61 
 
 		 189 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  35.51 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0552  signal peptidase IA, inactive  31.06 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  31.76 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  33.11 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2503  signal peptidase I  31.91 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  29.68 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  29.51 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  34.72 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  30.27 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  30.27 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  27.87 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  30.27 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  29.45 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  29.51 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  30.27 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  30.88 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  35.51 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  30.27 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  30.27 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  30.27 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  31.18 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2862  signal peptidase I  34.33 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  31.16 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  33.96 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  28.39 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  28.39 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0400  signal peptidase I  30.99 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  28.8 
 
 		 297 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  28.8 
 
 		 297 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>