More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1111 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  100 
 
 		 207 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2862  signal peptidase I  46.51 
 
 		 156 aa  111  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  31.4 
 
 		 189 aa  91.3  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  39.71 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  42.25 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  37.09 
 
 		 174 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  35.67 
 
 		 182 aa  88.2  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  36.88 
 
 		 272 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  34.69 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  31.74 
 
 		 183 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  33.15 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  33.13 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  35.66 
 
 		 173 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  28.43 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  34.19 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  33.33 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  35.98 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  29.82 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  37.11 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  31.08 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  27.59 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  28.9 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  28.9 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  34.51 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  37.74 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  33.33 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  34.56 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  35.77 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  35.77 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  33.78 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  30.59 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  27.93 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  33.11 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  31.55 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  33.52 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  28.81 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  28.24 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  35.11 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  34.76 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  28.24 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  33.33 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  38.3 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  32.07 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  33.78 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  38 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  29.82 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  29.94 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  29.94 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  31.82 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  29.94 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  29.38 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  30 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  30 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  30 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  33.52 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  29.38 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  30 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  30 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  30 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  28.05 
 
 		 172 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  30 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  31.65 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  29.69 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  29.38 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  28.57 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  28.57 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  30.41 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  31.43 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  32.73 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  29.86 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  30.48 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  29.41 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  28.81 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  29.86 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  32.75 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  29.41 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  28.81 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  28.81 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  31.07 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  29.38 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  33.33 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  33.13 
 
 		 257 aa  72  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  36.17 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  34.19 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  31.1 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  31.1 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  31.1 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  31.1 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  31.1 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  31.1 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  31.29 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  32.26 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0553  signal peptidase IB  30.82 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  34.55 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  31.16 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  32.07 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  31.85 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  33.14 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  33.33 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  29.27 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>