More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0553 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0553  signal peptidase IB  100 
 
 
191 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  79.58 
 
 
191 aa  319  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  79.58 
 
 
191 aa  319  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0024  signal peptidase I  54.92 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  47.57 
 
 
188 aa  179  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  45.95 
 
 
187 aa  177  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  45.95 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  45.95 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  45.95 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  45.41 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  45.41 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  45.41 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  45.41 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  45.41 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  45.95 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  45.3 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  45.3 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  45.3 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  45.3 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  45.3 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  45.3 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  45.6 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  45.3 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  47.37 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  44.75 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  44.75 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  43.65 
 
 
183 aa  161  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  43.96 
 
 
183 aa  160  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  45.29 
 
 
189 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  43.96 
 
 
183 aa  158  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  43.96 
 
 
183 aa  158  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  44.38 
 
 
183 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  43.41 
 
 
183 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  43.41 
 
 
183 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  43.41 
 
 
183 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  43.41 
 
 
183 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  43.41 
 
 
183 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  44.13 
 
 
186 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  43.41 
 
 
183 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  45.25 
 
 
184 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  43.41 
 
 
183 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  39.89 
 
 
207 aa  137  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1861  Signal peptidase I  39.68 
 
 
208 aa  125  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0958721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0393  signal peptidase I  39.23 
 
 
177 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  39.89 
 
 
192 aa  120  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  37.29 
 
 
173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0528  signal peptidase I S  39.01 
 
 
178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0392  signal peptidase I (SPase I)  39.01 
 
 
178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0552  signal peptidase IA, inactive  34.62 
 
 
173 aa  118  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0459  signal peptidase I S  39.01 
 
 
177 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  38.83 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0529  signal peptidase I S  39.01 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  39.36 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4845  signal peptidase I  39.56 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  37.16 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0400  signal peptidase I  37.5 
 
 
176 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1741  signal peptidase I  37.04 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0388  signal peptidase I  39.01 
 
 
178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.932746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  34.88 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  34.44 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0478  signal peptidase I  37.91 
 
 
177 aa  111  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1333  Signal peptidase I  36.51 
 
 
205 aa  111  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2062  Signal peptidase I  35.16 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  34.78 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  36.31 
 
 
214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  34.97 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0790  Signal peptidase I  32 
 
 
216 aa  109  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165061  hitchhiker  9.36355e-24 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  34.24 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  34.24 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  37.06 
 
 
171 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  32.02 
 
 
220 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2156  signal peptidase I  38.1 
 
 
173 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  34.08 
 
 
185 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  34.62 
 
 
186 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  34.71 
 
 
189 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  33.17 
 
 
288 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  35.05 
 
 
225 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  32.85 
 
 
271 aa  104  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1723  signal peptidase I  37.14 
 
 
197 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  35.09 
 
 
189 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  39.43 
 
 
187 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  31.11 
 
 
173 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3112  Signal peptidase I  37.04 
 
 
173 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  36.22 
 
 
169 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2871  Signal peptidase I  37.04 
 
 
173 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2841  signal peptidase I  37.04 
 
 
173 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000384139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  41.29 
 
 
173 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  36.67 
 
 
176 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3086  Signal peptidase I  37.04 
 
 
173 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3079  signal peptidase I  37.57 
 
 
173 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3092  signal peptidase I  37.04 
 
 
173 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  28.19 
 
 
216 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  30.5 
 
 
256 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3111  signal peptidase I  36.51 
 
 
173 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.349413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  32.46 
 
 
215 aa  101  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  32.45 
 
 
198 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1935  signal peptidase I  35.91 
 
 
201 aa  101  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.51 
 
 
199 aa  101  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  33.33 
 
 
220 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  32.77 
 
 
220 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>