More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0289 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0289  signal peptidase, putative  100 
 
 		 627 aa  1292    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  33.33 
 
 		 372 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  39.83 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  39.83 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  31.22 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  33.33 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  33.13 
 
 		 297 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  33.13 
 
 		 297 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  32.67 
 
 		 297 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  32.67 
 
 		 297 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  33.13 
 
 		 297 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  33.13 
 
 		 297 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  32.53 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  39.5 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  36.09 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  33.33 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  33.33 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  29.44 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  40.95 
 
 		 219 aa  67  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.33 
 
 		 219 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  29.86 
 
 		 219 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.13 
 
 		 198 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  32.79 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  33.9 
 
 		 221 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  36.13 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  33.9 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  37.01 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  31.58 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.86 
 
 		 199 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  33.07 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  36.3 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  37.61 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  31.08 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1242  signal peptidase I  35.04 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  37.82 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  30.72 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1201  signal peptidase I  35.04 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  35.56 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  35.56 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  30.32 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  40 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  40 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  26.94 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  33.8 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  29.19 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  36.51 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  35.2 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  36.61 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  32.52 
 
 		 189 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  37.19 
 
 		 266 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  31.25 
 
 		 299 aa  63.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  37.3 
 
 		 257 aa  63.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  28.09 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  34.19 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  32.17 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  32.17 
 
 		 216 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  40.26 
 
 		 191 aa  62.4  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  36.64 
 
 		 299 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  35.61 
 
 		 298 aa  62  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  32.06 
 
 		 279 aa  62  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  31.79 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  34.23 
 
 		 220 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  34.23 
 
 		 220 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  34.13 
 
 		 220 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  31.82 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  35.71 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  34.9 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  34.48 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  33.33 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  34.11 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  34.48 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  28.65 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  32.17 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  37.38 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  33.1 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  32.46 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  31.25 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  32 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  35.94 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  36 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  35.71 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  35.94 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  30.07 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  30.25 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  32.54 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  33.61 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  33.33 
 
 		 220 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  30.43 
 
 		 290 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  28.81 
 
 		 324 aa  59.7  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  31.39 
 
 		 250 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  26.47 
 
 		 378 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  34.58 
 
 		 238 aa  60.1  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  37.59 
 
 		 269 aa  60.1  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  32.41 
 
 		 297 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  33.12 
 
 		 364 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0326  signal peptidase I  34.68 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  34.38 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  33.03 
 
 		 206 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  34.38 
 
 		 288 aa  59.7  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  31.03 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>